RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574175.1

TRAP1-209, Transcript of TNF receptor associated protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRAP1, Length 535 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAP1-209ENST00000574175 STEAP2Q8NFT2 490 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 PIGXQ8TBF5 258 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 S100PBPQ96BU1 408 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 SPATA9Q9BWV2 254 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 RABEP2Q9H5N1 569 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 IKZF5Q9H5V7 419 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 SLC52A3Q9NQ40 469 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 EMC3Q9P0I2 261 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 TMEM181Q9P2C4 612 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 TRIM33Q9UPN9 1127 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 IFT52Q9Y366 437 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 A0A1W2PP18 115 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 ZNF724A8MTY0 619 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 ZNF814B7Z6K7 855 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 ZNF208O43345 1280 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 DNPH1O43598 174 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 RAMP1O60894 148 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 PGM3O95394 542 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 ADAP00813 363 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 ARAFP10398 606 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 IMPDH2P12268 514 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 CXCR1P25024 350 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 ZSWIM7Q19AV6 140 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 BEX5Q5H9J7 111 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 CCDC103Q8IW40 242 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 ZNF100Q8IYN0 542 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 STON2Q8WXE9 905 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 MBD6Q96DN6 1003 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 ARMC7Q9H6L4 198 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 BCL2L10Q9HD36 194 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 TMEM45AQ9NWC5 275 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 ZNF446Q9NWS9 450 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 CHST2Q9Y4C5 530 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 C2CD3Q4AC94 2353 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 ZFHX3Q15911 3703 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 EVPLLA8MZ36 301 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 LYZL6O75951 148 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 IGHV3-9P01782 118 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 CD53P19397 219 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 LOXP28300 417 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 HOXC5Q00444 222 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 CDK6Q00534 326 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 27.2
TRAP1-209ENST00000574175 BNIP2Q12982 314 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 DEFB113Q30KQ7 82 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 SFRP5Q5T4F7 317 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 WBP2NLQ6ICG8 309 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 DHDDSQ86SQ9 333 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 ALPK1Q96QP1 1244 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 ADAM19Q9H013 955 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 CXXC4Q9H2H0 198 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 ZNF385DQ9H6B1 395 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 TRAPPC4Q9Y296 219 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 ARID1AO14497 2285 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 ZNF716A6NP11 495 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 ANGPT2O15123 496 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 KLF4O43474 513 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 FPR1P21462 350 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 IDUAP35475 653 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 SLC35A1P78382 337 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 SCARB2Q14108 478 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 P2RY6Q15077 328 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 PDK3Q15120 406 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 STK11Q15831 433 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 REEP3Q6NUK4 255 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 Q6ZT83 130 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 KRT73Q86Y46 540 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 PLPPR2Q96GM1 343 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 SIKE1Q9BRV8 207 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 HDHD5Q9BXW7 423 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 OR10A4Q9H209 315 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 CORO2BQ9UQ03 480 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 NDUFAF1Q9Y375 327 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAP1-209ENST00000574175 GPR171O14626 319 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAP1-209ENST00000574175 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TRAP1-209ENST00000574175 ETS2P15036 469 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAP1-209ENST00000574175 AQP1P29972 269 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAP1-209ENST00000574175 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TRAP1-209ENST00000574175 ITGADQ13349 1161 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAP1-209ENST00000574175 CEACAM7Q14002 265 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAP1-209ENST00000574175 OR7A5Q15622 319 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAP1-209ENST00000574175 TAB1Q15750 504 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAP1-209ENST00000574175 CASP12Q6UXS9 341 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAP1-209ENST00000574175 DLEU7Q6UYE1 221 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAP1-209ENST00000574175 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms