RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572680.1

NEURL4-208, Transcript of neuralized E3 ubiquitin protein ligase 4, human

TSL 2

Gene NEURL4, Length 819 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEURL4-208	ENST00000572680		M0QX08	132 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	FRS3	O43559	492 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	SNX3	O60493	162 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	TPST1	O60507	370 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	CYTIP	O60759	359 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	MFN2	O95140	757 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	YES1	P07947	543 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	POU2F1	P14859	743 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	CD79B	P40259	229 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	GZMM	P51124	257 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	OR2B6	P58173	313 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	NCALD	P61601	193 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	SLC35A1	P78382	337 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	VMAC	Q2NL98	169 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	C12orf49	Q9H741	205 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680		A8MVM7	634 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	IDUA	P35475	653 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	HOXC5	Q00444	222 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	DMTN	Q08495	405 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	FAM27E3	Q08E93	113 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	BEND4	Q6ZU67	534 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	PIGX	Q8TBF5	258 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	C3orf49	Q96BT1	292 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	PSD2	Q9BQI7	771 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	TRIM2	Q9C040	744 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	BCO1	Q9HAY6	547 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	SH3D21	A4FU49	640 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	ZNF724	A8MTY0	619 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	AIM2	O14862	343 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	OPN1SW	P03999	348 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	C8B	P07358	591 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	EPX	P11678	715 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	IMPDH2	P12268	514 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	PDK3	Q15120	406 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	CCDC80	Q76M96	950 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	COMTD1	Q86VU5	262 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	SMYD1	Q8NB12	490 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	ELOA3	Q8NG57	546 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	LINC01560	Q8TB33	94 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	C12orf10	Q9HB07	376 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	SELENON	Q9NZV5	590 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	EMC3	Q9P0I2	261 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	C16orf97	H3BN30	126 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	LGI1	O95970	557 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	GPI	P06744	558 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	PNMT	P11086	282 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	KLK2	P20151	261 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	FPR1	P21462	350 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	UGT2B10	P36537	528 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	BNIP2	Q12982	314 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	VEZF1	Q14119	521 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	DUSP7	Q16829	419 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	ULK3	Q6PHR2	472 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	TREML1	Q86YW5	311 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	STK35	Q8TDR2	534 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	ZNF583	Q96ND8	569 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	DACH2	Q96NX9	599 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	ARHGDIG	Q99819	225 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEURL4-208	ENST00000572680	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24

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