RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546969.1

CASP9-211, Transcript of caspase 9, humanhuman

TSL 2

Gene CASP9, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9-211ENST00000546969 USF3Q68DE3 2245 aa14.98□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 ZFHX3Q15911 3703 aa14.98□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 A0A0G2JPF8 293 aa14.98□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa14.98□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa14.98□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 ZNF814B7Z6K7 855 aa14.98□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa14.98□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 BCHEP06276 602 aa14.98□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa14.98□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 PTH2RP49190 550 aa14.98□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 EPS8Q12929 822 aa14.98□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 TIMM23BQ5SRD1 257 aa14.98□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 NCMAPQ5T1S8 102 aa14.98□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 FBXW9Q5XUX1 488 aa14.98□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 KLHL17Q6TDP4 642 aa14.98□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 Q96MF0 132 aa14.98□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 C7orf26Q96N11 449 aa14.98□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 TMEM204Q9BSN7 226 aa14.98□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 TAPBPLQ9BX59 468 aa14.98□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 OR11A1Q9GZK7 315 aa14.98□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 TCF7L2Q9NQB0 619 aa14.98□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 FAIMQ9NVQ4 179 aa14.98□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 ASB6Q9NWX5 421 aa14.98□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 UPB1Q9UBR1 384 aa14.98□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 PRSS50Q9UI38 385 aa14.98□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 OSGIN1Q9UJX0 560 aa14.98□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa14.98□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 GPIP06744 558 aa14.97□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 ETFAP13804 333 aa14.97□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 TGFBR3Q03167 851 aa14.97□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 FADDQ13158 208 aa14.97□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 WBP2NLQ6ICG8 309 aa14.97□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 OR7E24Q6IFN5 339 aa14.97□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 ADAM5Q6NVV9 412 aa14.97□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 EPGNQ6UW88 154 aa14.97□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 CLEC9AQ6UXN8 241 aa14.97□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 DEPDC4Q8N2C3 294 aa14.97□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 CADM2Q8N3J6 435 aa14.97□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 RADILQ96JH8 1075 aa14.97□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 ARL5BQ96KC2 179 aa14.97□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 OR52B2Q96RD2 323 aa14.97□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 ALG2Q9H553 416 aa14.97□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 LAMP3Q9UQV4 416 aa14.97□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 CADP27708 2225 aa14.96□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 A0A096LPI6 279 aa14.96□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 A0A1W2PP18 115 aa14.96□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 CDHR4A6H8M9 788 aa14.96□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 AP3D1O14617 1153 aa14.96□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 PLAUP00749 431 aa14.96□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 THBS1P07996 1170 aa14.96□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 PPIBP23284 216 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 IDUAP35475 653 aa14.96□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 SLC16A1P53985 500 aa14.96□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 ATP5J2P56134 94 aa14.96□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 RNF220Q5VTB9 566 aa14.96□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa14.96□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa14.96□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 CASP12Q6UXS9 341 aa14.96□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 SLC38A5Q8WUX1 472 aa14.96□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 VPS33AQ96AX1 596 aa14.96□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 DNAJA3Q96EY1 480 aa14.96□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 TAS2R16Q9NYV7 291 aa14.96□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa14.96□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 MGAT4BQ9UQ53 548 aa14.96□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CASP9-211ENST00000546969 TMEM72A0PK05 275 aa14.95□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 OR5H1A6NKK0 313 aa14.95□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 CLIC1O00299 241 aa14.95□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 TFPTP0C1Z6 253 aa14.95□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 COX5AP20674 150 aa14.95□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 IGHV1-2P23083 117 aa14.95□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 BSPH1Q075Z2 132 aa14.95□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 ZNF311Q5JNZ3 666 aa14.95□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 PAQR6Q6TCH4 344 aa14.95□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 TMEM108Q6UXF1 575 aa14.95□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 VRK2Q86Y07 508 aa14.95□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 CCDC103Q8IW40 242 aa14.95□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 BBS10Q8TAM1 723 aa14.95□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 TMEM19Q96HH6 336 aa14.95□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa14.95□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 CCDC28BQ9BUN5 200 aa14.95□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 SPATA9Q9BWV2 254 aa14.95□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 ADAM19Q9H013 955 aa14.95□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 RLIMQ9NVW2 624 aa14.95□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 CORO2BQ9UQ03 480 aa14.95□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP14.94□□□□□ -0.02
CASP9-211ENST00000546969 ZNF716A6NP11 495 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms