RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544777.1

KDM5A-211, Transcript of lysine demethylase 5A, humanhuman

TSL 2

Gene KDM5A, Length 670 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5A-211ENST00000544777 BTBD2Q9BX70 525 aa8.75□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 OXSMQ9NWU1 459 aa8.75□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 ZNF225Q9UK10 706 aa8.75□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 MMP24Q9Y5R2 645 aa8.75□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa8.75□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 A0A1B0GUS0 222 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 TP73O15350 636 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 PIN1P1O15428 100 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 PDPK1O15530 556 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 KRT33AO76009 404 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 IGLV1-44P01699 117 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 GSTA2P09210 222 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 OMGP23515 440 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 PCGF2P35227 344 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 RBMXP38159 391 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 ATP12AP54707 1039 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 SESN3P58005 492 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 OR2B6P58173 313 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 TUBA1BP68363 451 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 TUBA4AP68366 448 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 DAG1Q14118 895 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 RASA2Q15283 850 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 SPDYAQ5MJ70 313 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 BRICD5Q6PL45 260 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 TUBA1AQ71U36 451 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 SPC24Q8NBT2 197 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 OR1K1Q8NGR3 316 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 ZFP28Q8NHY6 868 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 METTL6Q8TCB7 284 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 YIPF5Q969M3 257 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 C16orf58Q96GQ5 468 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 OSBPL9Q96SU4 736 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 VPS11Q9H270 941 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 SEC61A2Q9H9S3 476 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 SIRT5Q9NXA8 310 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 OPN4Q9UHM6 478 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 MID2Q9UJV3 735 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 DTNAQ9Y4J8 743 aa8.74□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 NR5A2O00482 541 aa8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 PLXNB1O43157 2135 aa8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 CYP7B1O75881 506 aa8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 LGI1O95970 557 aa8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 GSNP06396 782 aa8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 UBL4AP11441 157 aa8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 HSD17B3P37058 310 aa8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 EVX1P49640 407 aa8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 HTR6P50406 440 aa8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 DR1Q01658 176 aa8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 CLCQ05315 142 aa8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 ARMCX4Q5H9R4 360 aa8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 CDC73Q6P1J9 531 aa8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 KLHL7Q8IXQ5 586 aa8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 KIR3DL3Q8N743 410 aa8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 FAM169BQ8N8A8 192 aa8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 CDS1Q92903 461 aa8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 STACQ99469 402 aa8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 BEX1Q9HBH7 125 aa8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 DUSP22Q9NRW4 184 aa8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 ACER3Q9NUN7 267 aa8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 CHRNA9Q9UGM1 479 aa8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 NUP50Q9UKX7 468 aa8.73□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 ZNF587BE7ETH6 402 aa8.72□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 CLDN34H7C241 214 aa8.72□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 ANKRD28O15084 1053 aa8.72□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 IGKV3-15P01624 115 aa8.72□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 CELA3BP08861 270 aa8.72□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 ASMTP46597 345 aa8.72□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 CLK1P49759 484 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 MVKQ03426 396 aa8.72□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 NAB1Q13506 487 aa8.72□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 SLC17A1Q14916 467 aa8.72□□□□□ -1.01
KDM5A-211ENST00000544777 SLC9A3R2Q15599 337 aa8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms