RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC116Q8IYX3 515 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 POC1BQ8TC44 478 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 ASB11Q8WXH4 323 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 NELFAQ9H3P2 528 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 RNF150Q9ULK6 438 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 PPT2Q9UMR5 302 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 B4DXG7 233 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 ART1P52961 327 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 SCAND1P57086 179 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 GXYLT1Q4G148 440 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM69Q5SWH9 247 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM65Q6PI78 240 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 IL20RBQ6UXL0 311 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 ACBD7Q8N6N7 88 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 POMGNT2Q8NAT1 580 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 OR1J1Q8NGS3 322 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 HMGCLL1Q8TB92 370 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF596Q8TC21 504 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 RNF128Q8TEB7 428 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 P2RY13Q9BPV8 354 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 GALPQ9UBC7 116 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 B4GALT6Q9UBX8 382 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 DENND4CQ5VZ89 1909 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM210A6NLX4 147 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 LINC00587B1AMM8 73 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 H7C417 338 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 GFYI3L273 518 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 SCGB2A1O75556 95 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 MED6O75586 246 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 CRYABP02511 175 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 GP2P55259 537 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 CLDN8P56748 225 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 ETV3LQ6ZN32 361 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 CEACAM19Q7Z692 300 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 KDM8Q8N371 416 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 IL17RCQ8NAC3 791 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 SUMF2Q8NBJ7 301 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 FAM71CQ8NEG0 241 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 WBP2Q969T9 261 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 RNF31Q96EP0 1072 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 C3orf30Q96M34 536 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 OR52A5Q9H2C5 316 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 SLC6A20Q9NP91 592 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 P2RX2Q9UBL9 471 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 VEGFDO43915 354 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SLCO2B1O94956 709 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 MT-ND4LP03901 98 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 IL5P05113 134 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 QDPRP09417 244 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ADH5P11766 374 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 EDNRAP25101 427 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 CCR7P32248 378 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ARL3P36405 182 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 LIPAP38571 399 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 RAD52P43351 418 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 FHITP49789 147 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 CLCNKAP51800 687 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 RAB11BQ15907 218 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 OR2B11Q5JQS5 317 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 NCMAPQ5T1S8 102 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SHFQ7M4L6 423 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 GALNT10Q86SR1 603 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 OR52N1Q8NH53 320 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SLC22A12Q96S37 553 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SLC6A7Q99884 636 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SYT3Q9BQG1 590 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 PTDSS2Q9BVG9 487 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 CDCA4Q9BXL8 241 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SIRT5Q9NXA8 310 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 NDUFS8O00217 210 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 GJB3O75712 270 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 PMS2P2O95744 297 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SCG5P05408 212 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 C1SP09871 688 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 LAMP2P13473 410 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 OSMP13725 252 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ITGB7P26010 798 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 CSF2RBP32927 897 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 CCR9P51686 369 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 PTTG1IPP53801 180 aa5.65□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms