RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730	CALHM2	Q9HA72	323 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	AURKC	Q9UQB9	309 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	CENPE	Q02224	2701 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	C17orf51	A8MQB3	221 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	SEMA7A	O75326	666 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	PMS2P2	O95744	297 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	HTR2A	P28223	471 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	PER3	P56645	1201 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	CARD18	P57730	90 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	NUP107	P57740	925 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	RAC3	P60763	192 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	SLC35A1	P78382	337 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	HOXC5	Q00444	222 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	HBM	Q6B0K9	141 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	SEPHS2	Q99611	448 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	MED31	Q9Y3C7	131 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF175	Q9Y473	711 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730		V9GYQ6	96 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	POLE	Q07864	2286 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	ESPL1	Q14674	2120 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730		A0A1W2PRQ8	180 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	CD8B2	A6NJW9	211 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730		B4DXG7	233 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	SEC14L5	O43304	696 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	ADAM11	O75078	769 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	MT-ATP6	P00846	226 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	ACVR2A	P27037	513 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	SFTPD	P35247	375 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	IDUA	P35475	653 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	MAGEA2	P43356	314 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	ARHGDIA	P52565	204 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	CDH12	P55289	794 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	CLDN18	P56856	261 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	DGCR6	Q14129	220 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	OR2A2	Q6IF42	318 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	LACC1	Q8IV20	430 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	SLC43A2	Q8N370	569 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	C7orf34	Q96L11	122 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	OR5B2	Q96R09	309 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	UCN2	Q96RP3	112 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	TM9SF2	Q99805	663 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	GLRX2	Q9NS18	164 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	CREBBP	Q92793	2442 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	NCKAP5	O14513	1909 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730		E9PLN8	166 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	SULT2B1	O00204	365 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	GNGT2	O14610	69 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	GADD45G	O95257	159 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	SEMG1	P04279	462 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	HIST1H2AB	P04908	130 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	STS	P08842	583 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	TNFRSF1B	P20333	461 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	ACTR3	P61158	418 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	SRY	Q05066	204 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		13.74	□□□□□ -0.21

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