RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533051.5

SLC43A3-222, Transcript of solute carrier family 43 member 3, human

TSL 2

Gene SLC43A3, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC43A3-222	ENST00000533051	CXCR1	P25024	350 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	CTSS	P25774	331 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	NUDT2	P50583	147 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	PON3	Q15166	354 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	OR10D3	Q8NH80	312 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	OSTF1	Q92882	214 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	RLIM	Q9NVW2	624 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	ZNF175	Q9Y473	711 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051		H0YC42	278 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	CXCL13	O43927	109 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	IFNA14	P01570	189 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	GKN3P	P0CG01	181 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	CCNA2	P20248	432 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	PRKAR1B	P31321	381 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	SLC1A3	P43003	542 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	CTBP2	P56545	445 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	MXRA7	P84157	204 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	DMTN	Q08495	405 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	RABL3	Q5HYI8	236 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	RNF217	Q8TC41	542 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	POC1B	Q8TC44	478 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	DDIT4L	Q96D03	193 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	PERP	Q96FX8	193 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	OR5B2	Q96R09	309 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051		A0A1W2PPR1	153 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	SYT5	O00445	386 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	GSTA4	O15217	222 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	RCBTB2	O95199	551 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	PRDX6	P30041	224 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	CPA2	P48052	419 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	EPS8	Q12929	822 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	SELPLG	Q14242	412 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	MAPK11	Q15759	364 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	VMAC	Q2NL98	169 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	GGN	Q86UU5	652 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	UCN2	Q96RP3	112 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051		A0A0J9YW62	118 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051		M0QX08	132 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	SULT2B1	O00204	365 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	FAAH	O00519	579 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	AP3D1	O14617	1153 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	ADAMDEC1	O15204	470 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	GMNN	O75496	209 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	12.76	□□□□□ -0.37	1e-6	■■■■■ 27
SLC43A3-222	ENST00000533051	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	FAM107A	O95990	144 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	CRH	P06850	196 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	EPX	P11678	715 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	TACR3	P29371	465 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	PCGF2	P35227	344 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	MNAT1	P51948	309 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	MAP2K6	P52564	334 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SLC43A3-222	ENST00000533051	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37

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