RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529404.5

FADS3-208, Transcript of fatty acid desaturase 3, human

TSL 2

Gene FADS3, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FADS3-208	ENST00000529404	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	CENPX	A8MT69	81 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	PPM1B	O75688	479 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	OR2T7	P0C7T2	308 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	PYCR1	P32322	319 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	GALNS	P34059	522 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	ACVR1B	P36896	505 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	CAPZB	P47756	277 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	OR10A3	P58181	314 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	ARL14	Q8N4G2	192 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	OR2T27	Q8NH04	317 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	OR4C3	Q8NH37	302 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	RNF170	Q96K19	258 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	13.9	□□□□□ -0.18	2e-7	■■□□□ 11.4
FADS3-208	ENST00000529404	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	RASD1	Q9Y272	281 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	CSTA	P01040	98 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	CD1A	P06126	327 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	NPR2	P20594	1047 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	ALAS2	P22557	587 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	HSD17B7	P56937	341 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	ISX	Q2M1V0	245 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	GHSR	Q92847	366 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	C3orf49	Q96BT1	292 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FADS3-208	ENST00000529404	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	FAM172BP	A6NC97	362 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	OR2W5	A6NFC9	320 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	GNB5	O14775	395 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	ARPC3	O15145	178 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	OR7A10	O76100	309 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	PROS1	P07225	676 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	PSKH1	P11801	424 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	MAOA	P21397	527 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	HCCS	P53701	268 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	NDUFA5	Q16718	116 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	CDON	Q4KMG0	1287 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	MSANTD3	Q96H12	275 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	LILRA5	A6NI73	299 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	LRRN3	E7EW58	273 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	DIO1	P49895	249 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	ACTA2	P62736	377 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	ACTG2	P63267	376 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	COL19A1	Q14993	1142 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	NNAT	Q16517	81 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	TATDN3	Q17R31	274 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	TP53I3	Q53FA7	332 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	KLHL26	Q53HC5	615 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	PELI1	Q96FA3	418 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	NLK	Q9UBE8	527 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	SLC43A1	O75387	559 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	SERPINA3	P01011	423 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	ADH7	P40394	386 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	PGD	P52209	483 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	CDK5R1	Q15078	307 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FADS3-208	ENST00000529404	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		13.88	□□□□□ -0.19

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