RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524238.3

HMBOX1-211, Transcript of homeobox containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HMBOX1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1-211ENST00000524238 LRRC72A6NJI9 287 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 MCIDASD6RGH6 385 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 H7C417 338 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 RTCAO00442 366 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF432O94892 652 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 SIX6O95475 246 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 CD8AP01732 235 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 RLN2P04090 185 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ASGR1P07306 291 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 AKAIN1P0CW23 69 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 CTSAP10619 480 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ERGP11308 486 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 TBXA2RP21731 343 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC2A5P22732 501 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 EDNRAP25101 427 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC6A6P31641 620 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 TSFMP43897 325 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 PTH2RP49190 550 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 EPHB3P54753 998 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 RAB5BP61020 215 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 PPP2CBP62714 309 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 PPP2CAP67775 309 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 FKBP1BP68106 108 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 CBFBQ13951 182 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 GGTLC2Q14390 218 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 C9orf64Q5T6V5 341 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC6A19Q695T7 634 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ELP2Q6IA86 826 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM122BQ7Z309 247 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 VRK2Q86Y07 508 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM185AQ8NFB2 350 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 NUP43Q8NFH3 380 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 OR6S1Q8NH40 331 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ELP5Q8TE02 316 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ADAMTS15Q8TE58 950 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM255BQ8WV15 326 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 SNX33Q8WV41 574 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ASB12Q8WXK4 309 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 PMM1Q92871 262 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 TCEAL3Q969E4 200 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF251Q9BRH9 671 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 POTEKPQ9BYX7 375 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 SEMA4CQ9C0C4 833 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 OR51V1Q9H2C8 321 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ZFP57Q9NU63 452 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 RNF181Q9P0P0 153 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 CPNE7Q9UBL6 633 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 MTFP1Q9UDX5 166 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 IL20RAQ9UHF4 553 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 MAFFQ9ULX9 164 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC7A7Q9UM01 511 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM82A0PJX8 343 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM200CA6NKL6 621 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 CDC42EP2O14613 210 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 XRCC3O43542 346 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 VEGFDO43915 354 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 TMPRSS11DO60235 418 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 CTNSO60931 367 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ADAMTS4O75173 837 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF254O75437 659 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 GLSO94925 669 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ABLIM3O94929 683 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 PAPLNO95428 1278 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 RLN1P04808 185 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 GALTP07902 379 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ZGLP1P0C6A0 271 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ELFN1P0C7U0 828 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ACADLP28330 430 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 NOS3P29474 1203 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 RBM34P42696 430 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 H2BFSP57053 126 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 TAS2R20P59543 309 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ACTBP60709 375 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ACTG1P63261 375 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 DCDP81605 110 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 SORDQ00796 357 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 TOMM20Q15388 145 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 GUCA2BQ16661 112 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms