RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GTF2H4Q92759 462 aa13.4□□□□□ -0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VPS33AQ96AX1 596 aa13.4□□□□□ -0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 APH1AQ96BI3 265 aa13.4□□□□□ -0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MUCL1Q96DR8 90 aa13.4□□□□□ -0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa13.4□□□□□ -0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GSX2Q9BZM3 304 aa13.4□□□□□ -0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADAM19Q9H013 955 aa13.4□□□□□ -0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CXorf56Q9H5V9 222 aa13.4□□□□□ -0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TCF7L2Q9NQB0 619 aa13.4□□□□□ -0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM45AQ9NWC5 275 aa13.4□□□□□ -0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PARPBPQ9NWS1 579 aa13.4□□□□□ -0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRSS50Q9UI38 385 aa13.4□□□□□ -0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RNF115Q9Y4L5 304 aa13.4□□□□□ -0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ROS1P08922 2347 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NF1P21359 2839 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM171A2A8MVW0 826 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LYZL6O75951 148 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PLAUP00749 431 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BCHEP06276 602 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CD3EP07766 207 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 INHBBP09529 407 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PAX1P15863 534 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GGT1P19440 569 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 COX5AP20674 150 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CXCR1P25024 350 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 COPZ1P61923 177 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TIMM23BQ5SRD1 257 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RNF220Q5VTB9 566 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UBE2J2Q8N2K1 259 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR9I1Q8NGQ6 314 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGFBPL1Q8WX77 278 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC28BQ9BUN5 200 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BDH2Q9BUT1 245 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RLIMQ9NVW2 624 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IFT52Q9Y366 437 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARID1AO14497 2285 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM72A0PK05 275 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLIC1O00299 241 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PGM3O95394 542 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGHV1-2P23083 117 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IDH3AP50213 366 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FADDQ13158 208 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPA1Q15181 289 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RGNQ15493 299 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GTDC1Q4AE62 458 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WBP2NLQ6ICG8 309 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PAQR6Q6TCH4 344 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VRK2Q86Y07 508 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC103Q8IW40 242 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PERPQ96FX8 193 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPATA9Q9BWV2 254 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BCL2L10Q9HD36 194 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A4GALTQ9NPC4 353 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ASB6Q9NWX5 421 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A0A096LPI6 279 aa13.37□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR5H1A6NKK0 313 aa13.37□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLOCKO15516 846 aa13.37□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GPIP06744 558 aa13.37□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IMPDH2P12268 514 aa13.37□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BMP2P12643 396 aa13.37□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EDNRAP25101 427 aa13.37□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PTH2RP49190 550 aa13.37□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 STK11Q15831 433 aa13.37□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa13.37□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR7E24Q6IFN5 339 aa13.37□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC2A7Q6PXP3 512 aa13.37□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa13.37□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF836Q6ZNA1 936 aa13.37□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa13.37□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DYDC1Q8WWB3 177 aa13.37□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC35B4Q969S0 331 aa13.37□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FBXW5Q969U6 566 aa13.37□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM19Q96HH6 336 aa13.37□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PIF1Q9H611 641 aa13.37□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa13.37□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MALT1Q9UDY8 824 aa13.37□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa13.37□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FREM1Q5H8C1 2179 aa13.37□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DSCAMO60469 2012 aa13.36□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CIB4A0PJX0 185 aa13.36□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DPRXA6NFQ7 191 aa13.36□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCT8L1PA6NM43 557 aa13.36□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A8MVM7 634 aa13.36□□□□□ -0.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C5orf58C9J3I9 102 aa13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms