RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495399.1

C9orf135-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-204ENST00000495399 CRATP43155 626 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 STARP49675 285 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 GZMMP51124 257 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 MTPNP58546 118 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 DSTNP60981 165 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 PLAURQ03405 335 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 FADDQ13158 208 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 EFR3AQ14156 821 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 ADRM1Q16186 407 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 MMEL1Q495T6 779 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 FBLN7Q53RD9 439 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 RABL3Q5HYI8 236 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 TIGD3Q6B0B8 471 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 NANOGP8Q6NSW7 305 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 FRRS1Q6ZNA5 592 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 HMGN2P46Q86SG4 172 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 PTOV1Q86YD1 416 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 FBXO27Q8NI29 283 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 SLC38A5Q8WUX1 472 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 MAL2Q969L2 176 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 ROPN1LQ96C74 230 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 ZG16BQ96DA0 208 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 LRRC37BQ96QE4 947 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 TM9SF2Q99805 663 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 KLHDC3Q9BQ90 382 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 SFXN3Q9BWM7 321 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 OSBPL11Q9BXB4 747 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 SAP130Q9H0E3 1048 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 NANOGQ9H9S0 305 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 MKLN1Q9UL63 735 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 USP22Q9UPT9 525 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 DSPPQ9NZW4 1301 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 FAM157AC9JC47 383 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 SCO2O43819 266 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 KIAA0513O60268 411 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 UGT2B17O75795 530 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 H6PDO95479 791 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 AGR2O95994 175 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 ACTL6AO96019 429 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 AK1P00568 194 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 NPPAP01160 153 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 CD8AP01732 235 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 BCHEP06276 602 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 T-ENOLP0DO92 83 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 CPN1P15169 458 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 PPIBP23284 216 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 SLC6A2P23975 617 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 MAGEA8P43361 318 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 CHRNEQ04844 493 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 STX5Q13190 355 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 GPR68Q15743 365 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 CD226Q15762 336 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF141Q15928 474 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 MAPK14Q16539 360 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 GPAT3Q53EU6 434 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 KLHL26Q53HC5 615 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 ADAM5Q6NVV9 412 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 SLC30A6Q6NXT4 461 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 HACD2Q6Y1H2 254 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 C16orf62Q7Z3J2 963 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 MARCH3Q86UD3 253 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 CALHM3Q86XJ0 350 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 SLC15A3Q8IY34 581 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 WDSUB1Q8N9V3 476 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 OR1J4Q8NGS1 313 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 OR14L1PQ8NHC6 308 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 TMCO6Q96DC7 493 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 TMEM41AQ96HV5 264 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 MED18Q9BUE0 208 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 PIGMQ9H3S5 423 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 METTL7AQ9H8H3 244 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 A4GALTQ9NPC4 353 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 UBQLN4Q9NRR5 601 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 EXD2Q9NVH0 621 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 KLRF1Q9NZS2 232 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 P2RX2Q9UBL9 471 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 PACSIN3Q9UKS6 424 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf135-204ENST00000495399 ABCG2Q9UNQ0 655 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms