RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 POT1Q9NUX5 634 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 RP1P56715 2156 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CCDC182A6NF36 153 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 STMND1H3BQB6 276 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 LINC01387J3KSC0 135 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CYR61O00622 381 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SOCS6O14544 535 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PRODHO43272 600 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CHST10O43529 356 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 STX11O75558 287 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CDRT1O95170 752 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 S100A6P06703 90 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CAPZA2P47755 286 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ZNF136P52737 540 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 GALEQ14376 348 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ISXQ2M1V0 245 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 FLYWCH1Q4VC44 716 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 WDR88Q6ZMY6 472 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CFAP77Q6ZQR2 320 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 GKN2Q86XP6 184 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CPOQ8IVL8 374 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CA13Q8N1Q1 262 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 LINC00471Q8N535 108 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PMM1Q92871 262 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 FGF11Q92914 225 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 GAREM1Q9H706 876 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 C20orf141Q9NUB4 165 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SSR3Q9UNL2 185 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 A0A0G2JMP0 313 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 OR5K3A6NET4 321 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 OR6C70A6NIJ9 312 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PRSS44E7EML9 344 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SULT1B1O43704 296 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 UPK1BO75841 260 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 MED26O95402 600 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 HTR2AP28223 471 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SSTR4P31391 388 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CRYBB2P43320 205 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CAV3P56539 151 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 GRM7Q14831 915 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 OR52R1Q8NGF1 315 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 OR51A7Q8NH64 312 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 RIT1Q92963 219 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PTCHD1Q96NR3 888 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 MAP3K3Q99759 626 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 GON7Q9BXV9 100 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 BARHL1Q9BZE3 327 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SLC26A1Q9H2B4 701 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ANKHQ9HCJ1 492 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PTGFRNQ9P2B2 879 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ZNF98A6NK75 572 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 C21orf140B9A014 251 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SDC3O75056 442 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 C1QTNF9P0C862 333 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SAGP10523 405 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 AGAP20933 346 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ITGA3P26006 1051 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PGDP52209 483 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 RPS25P62851 125 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CDC20Q12834 499 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 OR1Q1Q15612 314 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 KLHL12Q53G59 568 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 KLHL22Q53GT1 634 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PDZK1Q5T2W1 519 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PLBD1Q6P4A8 553 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 NOXA1Q86UR1 476 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 LAPTM4BQ86VI4 370 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 OR8H2Q8N162 312 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ZNF619Q8N2I2 560 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CDRT4Q8N9R6 151 aa6.45□□□□□ -1.38
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