RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 PRR14Q9BWN1 585 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SLC19A3Q9BZV2 496 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ERVK-18Q9QC07 812 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 PRDM4Q9UKN5 801 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CDHR4A6H8M9 788 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 FAM166BA8MTA8 275 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 H0YC42 278 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CCRL2O00421 344 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 IDH3BO43837 385 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
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PTPRD-211ENST00000486161 MT-ND2P03891 347 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 F13BP05160 661 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SLC10A1Q14973 349 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ACER2Q5QJU3 275 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 HBMQ6B0K9 141 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa7.6□□□□□ -1.19
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PTPRD-211ENST00000486161 TMEM163Q8TC26 289 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 NRG4Q8WWG1 115 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 MRGPRX4Q96LA9 322 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 KATNB1Q9BVA0 655 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 TMED9Q9BVK6 235 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ENKD1Q9H0I2 346 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 TRAV17A0A0B4J275 112 aa7.59□□□□□ -1.19
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PTPRD-211ENST00000486161 SLC43A1O75387 559 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 OR7A10O76100 309 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 AQP2P41181 271 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 PRSS48Q7RTY5 328 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ZBTB44Q8NCP5 570 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 OR4N2Q8NGD1 307 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 OR51L1Q8NGJ5 315 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 TTTY10Q9BZA0 68 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ULBP2Q9BZM5 246 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SEMA4CQ9C0C4 833 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ACER3Q9NUN7 267 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 LTBP2Q14767 1821 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SLC16A7O60669 478 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 VAMP5O95183 116 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 GRK5P34947 590 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 DAPP51397 102 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CXCR4P61073 352 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 FGFBP1Q14512 234 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 EBPQ15125 230 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 NADK2Q4G0N4 442 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 LRFN4Q6PJG9 635 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa7.59□□□□□ -1.19
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PTPRD-211ENST00000486161 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CD14P08571 375 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 GRPRP30550 384 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 RORCP51449 518 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 RPS18P62269 152 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
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PTPRD-211ENST00000486161 FAM189A2Q15884 450 aa7.59□□□□□ -1.19
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PTPRD-211ENST00000486161 PGBD2Q6P3X8 592 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 AAED1Q7RTV5 226 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 NKAIN4Q8IVV8 208 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC103Q8IW40 242 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 UCN3Q969E3 161 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 MGLLQ99685 303 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 COQ7Q99807 217 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 PRO3102Q9H379 93 aa7.59□□□□□ -1.19
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PTPRD-211ENST00000486161 RNF6Q9Y252 685 aa7.59□□□□□ -1.19
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PTPRD-211ENST00000486161 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
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PTPRD-211ENST00000486161 DLL1O00548 723 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CT62P0C5K7 136 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SOX3P41225 446 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CMPK2Q5EBM0 449 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 C11orf88Q6PI97 169 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF566Q969W8 418 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ZBTB8AQ96BR9 441 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 PGAM5Q96HS1 289 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 INTS14Q96SY0 518 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SNTG1Q9NSN8 517 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
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