RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409945.1

USP40-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP40, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-202ENST00000409945 K7EM74 188 aa5.76□□□□□ -1.49
USP40-202ENST00000409945 PLPP2O43688 288 aa5.76□□□□□ -1.49
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USP40-202ENST00000409945 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
USP40-202ENST00000409945 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
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USP40-202ENST00000409945 IL11P20809 199 aa5.76□□□□□ -1.49
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USP40-202ENST00000409945 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
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USP40-202ENST00000409945 C11orf87Q6NUJ2 197 aa5.76□□□□□ -1.49
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USP40-202ENST00000409945 ZNF678Q5SXM1 525 aa5.74□□□□□ -1.49
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USP40-202ENST00000409945 BEST3Q8N1M1 668 aa5.74□□□□□ -1.49
USP40-202ENST00000409945 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.74□□□□□ -1.49
USP40-202ENST00000409945 WDR20Q8TBZ3 569 aa5.74□□□□□ -1.49
USP40-202ENST00000409945 ELP5Q8TE02 316 aa5.74□□□□□ -1.49
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