RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 CSO75390 466 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 RAB3AP20336 220 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 MAOAP21397 527 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 RACK1P63244 317 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 DUSP5Q16690 384 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 FAM76BQ5HYJ3 339 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 IL17RCQ8NAC3 791 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 OR5H2Q8NGV7 314 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 OR2T35Q8NGX2 323 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 OR2S2Q9NQN1 319 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 NAP1L6A6NFF2 107 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 OR8G3PP0DMU2 310 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 CD34P28906 385 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 GARNL3Q5VVW2 1013 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 METTL15A6NJ78 407 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 UTS2O95399 124 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 CD27P26842 260 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 HOXC8P31273 242 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 TRIM23P36406 574 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 NR4A2P43354 598 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 SIMC1Q8NDZ2 872 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 OR52I1Q8NGK6 324 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 MFSD8Q8NHS3 518 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 PLEK2Q9NYT0 353 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 ABRACLQ9P1F3 81 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 MMP17Q9ULZ9 603 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 A6NLC8 198 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 H7C1C5 153 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 GPRIN2O60269 458 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 RAB3DO95716 219 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 LIPAP38571 399 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 LCN6P62502 163 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 PATE1Q8WXA2 126 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 SLC46A1Q96NT5 459 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 ALG12Q9BV10 488 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 SEMA4GQ9NTN9 838 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 POLHQ9Y253 713 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 ZNF281Q9Y2X9 895 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 SUSD5O60279 629 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 THBS2P35442 1172 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 FAM219BQ5XKK7 198 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 MLXQ9UH92 298 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 HIF3AQ9Y2N7 669 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 FTCDNL1E5RQL4 147 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 PIP5K1CO60331 668 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 HTR3BO95264 441 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 LGI1O95970 557 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 ARSBP15848 533 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 OPN5Q6U736 354 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 RSC1A1Q92681 617 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 SLC6A20Q9NP91 592 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 GLS2Q9UI32 602 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 MEIOCA2RUB1 952 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 YY2O15391 372 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 HTR1FP30939 366 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 FGL1Q08830 312 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 C7orf34Q96L11 122 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 NMNAT3Q96T66 252 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 SLC39A1Q9NY26 324 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 TMEM72A0PK05 275 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 CER1O95813 267 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 AGTR1P30556 359 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 OR51T1Q8NGJ9 327 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 SIT1Q9Y3P8 196 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 OR2A25A4D2G3 310 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 C1QAP02745 245 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 OR2T7P0C7T2 308 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 PCSK6P29122 969 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 ARL6IP1Q15041 203 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 ANKRD34AQ69YU3 496 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 OR4N4Q8N0Y3 316 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 OR2T27Q8NH04 317 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 NUDT22Q9BRQ3 303 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 FN3KQ9H479 309 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 MMACHCQ9Y4U1 282 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 DIRAS3O95661 229 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 METTL11BQ5VVY1 283 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 UBQLN3Q9H347 655 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 KCNN3Q9UGI6 736 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 CLEC2DQ9UHP7 191 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 EFCAB7A8K855 629 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 CSF1P09603 554 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 LAX1Q8IWV1 398 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 STOML3Q8TAV4 291 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 KCNS2Q9ULS6 477 aa19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms