RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 RASD2Q96D21 266 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 DNAJA3Q96EY1 480 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 PELI1Q96FA3 418 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 FKRPQ9H9S5 495 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 DUSP22Q9NRW4 184 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 HCN3Q9P1Z3 774 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 TEKT2Q9UIF3 430 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 C2orf72A6NCS6 295 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 ANKRD61A6NGH8 418 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 EPOPA6NHQ4 379 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 PRR32B1ATL7 298 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 TNFRSF10AO00220 468 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 OR10H2O60403 315 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 TCRBP04435 133 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 WNT1P04628 370 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 PTHLHP12272 177 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 EDNRAP25101 427 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 SSTR2P30874 369 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 NTSR1P30989 418 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 CLDN12P56749 244 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 PSG6Q00889 435 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 CEP78Q5JTW2 689 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 C9orf50Q5SZB4 431 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 OTPQ5XKR4 325 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 PYHIN1Q6K0P9 492 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 SERPINA12Q8IW75 414 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 SLC35F2Q8IXU6 374 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 TOMM5Q8N4H5 51 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 CSNK1A1LQ8N752 337 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 GATSQ8NAP1 163 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 CAMKVQ8NCB2 501 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 OR6K6Q8NGW6 343 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 HMGB4Q8WW32 186 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 SCMH1Q96GD3 660 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 SPACA7Q96KW9 195 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 WDR92Q96MX6 357 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 NMNAT3Q96T66 252 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 PBX4Q9BYU1 374 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 DPAGT1Q9H3H5 408 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 GHITMQ9H3K2 345 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 FAM60AQ9NP50 221 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 ZFP64Q9NPA5 681 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 POT1Q9NUX5 634 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 OBP2AQ9NY56 170 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 MGAT4AQ9UM21 535 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 SATB2Q9UPW6 733 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM5Q9Y2B1 443 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 DOCK8Q8NF50 2099 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 FANCMQ8IYD8 2048 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 FLRT2O43155 660 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 TNFSF14O43557 240 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 GMFGO60234 142 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 KCNJ13O60928 360 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 EPXP11678 715 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 STOMP27105 288 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 SLC6A6P31641 620 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 RPL4P36578 427 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 MAP3K8P41279 467 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 PGDP52209 483 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 KIAA1024LP59773 190 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 BTG1P62324 171 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 ERVK-25P63136 954 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 CDK5R1Q15078 307 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 ST3GAL2Q16842 350 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 FAM209AQ5JX71 171 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF613Q6PF04 617 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 NPSR1Q6W5P4 371 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF671Q8TAW3 534 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 GIMAP1Q8WWP7 306 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 RELTQ969Z4 430 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 SLC22A18Q96BI1 424 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 SIPA1Q96FS4 1042 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 TSSK2Q96PF2 358 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 LMF1Q96S06 567 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 STACQ99469 402 aa6.68□□□□□ -1.34
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