RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 TAS2R16Q9NYV7 291 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 CLEC2DQ9UHP7 191 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 ZNF229Q9UJW7 825 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 J3QRE1 110 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 SLC2A10O95528 541 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 UMODP07911 640 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 RAB40ALP0C0E4 278 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 FBXO45P0C2W1 286 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 TSPAN19P0C672 248 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 HSMCR30P0CW71 290 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 NOS3P29474 1203 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 SERPINB10P48595 397 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 CLK1P49759 484 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 LIMK1P53667 647 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 WNT4P56705 351 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 DGUOKQ16854 277 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 PLBD1Q6P4A8 553 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 PTP4A1Q93096 173 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 C8orf44Q96CB5 159 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 RNF31Q96EP0 1072 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 IMMP1LQ96LU5 166 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 OPALINQ96PE5 141 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 FAM117AQ9C073 453 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 FKRPQ9H9S5 495 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 NRIP3Q9NQ35 241 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 NANSQ9NR45 359 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 OSGIN1Q9UJX0 560 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 PADI1Q9ULC6 663 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 EXPH5Q8NEV8 1989 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 ANKUB1A6NFN9 424 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 WWP2O00308 870 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 GNB5O14775 395 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 PLD2O14939 933 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 GDF9O60383 454 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 CLPXO76031 633 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 PPP1R3DO95685 299 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 MT-ATP6P00846 226 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 ASAH2BP0C7U1 165 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 CDK4P11802 303 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 ETV5P41161 510 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 FOLR3P41439 243 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 CAPZA2P47755 286 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 ETV1P50549 477 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 MAP2K6P52564 334 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 FBXW4P57775 412 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 EGR4Q05215 589 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 POU4F2Q12837 409 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 LYPD8Q6UX82 237 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 USP43Q70EL4 1123 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 RAB11FIP2Q7L804 512 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 ATCAYQ86WG3 371 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 SLC37A3Q8NCC5 494 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 GALNT6Q8NCL4 622 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 OR6S1Q8NH40 331 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 STK35Q8TDR2 534 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 DUSP19Q8WTR2 217 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 NACC2Q96BF6 587 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 DEPDC7Q96QD5 511 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 TAS2R10Q9NYW0 307 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 VCANP13611 3396 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 SCO2O43819 266 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 STK17BO94768 372 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 COX6A1P12074 109 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 GADD45AP24522 165 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 VBP1P61758 197 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 ACSM1Q08AH1 577 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 QPRTQ15274 297 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 NTRK2Q16620 822 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 MOGQ16653 247 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 TSTQ16762 297 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 EMC4Q5J8M3 183 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 TMEM81Q6P7N7 255 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 BBS1Q8NFJ9 593 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 KBTBD8Q8NFY9 601 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 OR5M3Q8NGP4 307 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 OR52N1Q8NH53 320 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 TBC1D15Q8TC07 691 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 PMEPA1Q969W9 287 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 DACH2Q96NX9 599 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 MESP1Q9BRJ9 268 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 EDEM2Q9BV94 578 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 SIAEQ9HAT2 523 aa14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.3 ms