RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 SEC14L5O43304 696 aa15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 PTGFRP43088 359 aa15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 EPHB3P54753 998 aa15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 CXADRP78310 365 aa15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 LTBQ06643 244 aa15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 AVL9Q8NBF6 648 aa15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 LRIG1Q96JA1 1093 aa15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 TOLLIPQ9H0E2 274 aa15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 NRIP3Q9NQ35 241 aa15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 POLR1DQ9Y2S0 133 aa15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 OR5H14A6NHG9 310 aa15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 FAM171A2A8MVW0 826 aa15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 POP4O95707 220 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 SLC35G4P0C7Q5 338 aa15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 SDHAP31040 664 aa15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 PGFP49763 221 aa15.46■□□□□ 0.07
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PACS1-201ENST00000320580 TMEM150AQ86TG1 271 aa15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 OR1F2PQ96R84 312 aa15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 MYNNQ9NPC7 610 aa15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 KCNMB2Q9Y691 235 aa15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 H7BY64 318 aa15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 GJB5O95377 273 aa15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 NT5EP21589 574 aa15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 TUBG1P23258 451 aa15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 ARFRP1Q13795 201 aa15.46■□□□□ 0.07
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PACS1-201ENST00000320580 FATE1Q969F0 183 aa15.46■□□□□ 0.07
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PACS1-201ENST00000320580 PRAP1Q96NZ9 151 aa15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 CMKLR1Q99788 373 aa15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 DMRT3Q9NQL9 472 aa15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 A0A087WUU8 490 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 TMEM218A2RU14 115 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 CR2P20023 1033 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 BDKRB2P30411 391 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 CBFBQ13951 182 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 OR2F2O95006 317 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 PET100P0DJ07 73 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 GABRR2P28476 465 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 RING1Q06587 406 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 OR2F1Q13607 317 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 TFAP2EQ6VUC0 442 aa15.45■□□□□ 0.06
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PACS1-201ENST00000320580 PLD4Q96BZ4 506 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 CBY1Q9Y3M2 126 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 EVPLQ92817 2033 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 SGSHP51688 502 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 NHLRC3Q5JS37 347 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 ARHGAP40Q5TG30 622 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 POMZP3Q6PJE2 187 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 VRK2Q86Y07 508 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 OR2A12Q8NGT7 310 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 MYLIPQ8WY64 445 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 RSRP1Q9BUV0 290 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 TMEM72A0PK05 275 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 ARRDC5A6NEK1 342 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 DRGXA6NNA5 263 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 DRD2P14416 443 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 G0S2P27469 103 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 RSU1Q15404 277 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 TCEAL6Q6IPX3 200 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 BPIFB2Q8N4F0 458 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 SEMA4GQ9NTN9 838 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 GHRLQ9UBU3 117 aa15.45■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP15.44■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 F12P00748 615 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 BATFQ16520 125 aa15.44■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 TMEM201Q5SNT2 666 aa15.44■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 NXPE4Q6UWF7 544 aa15.44■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 TTC9BQ8N6N2 239 aa15.44■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 NUP43Q8NFH3 380 aa15.44■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 FOXJ1Q92949 421 aa15.44■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 ORAI1Q96D31 301 aa15.44■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 DERL3Q96Q80 235 aa15.44■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 SMIM3Q9BZL3 60 aa15.44■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 MELKQ14680 651 aa15.44■□□□□ 0.06
PACS1-201ENST00000320580 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
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