RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291547.9

PKNOX1-201, Transcript of PBX/knotted 1 homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKNOX1, Length 5,003 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX1-201ENST00000291547 S100A8P05109 93 aa10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 GPX3P22352 226 aa10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 GBX1Q14549 363 aa10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 SOHLH1Q5JUK2 328 aa10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 MANEALQ5VSG8 457 aa10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 FBXW12Q6X9E4 464 aa10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 FCRLAQ7L513 359 aa10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 MFSD6LQ8IWD5 586 aa10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 SKA3Q8IX90 412 aa10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 TP53INP2Q8IXH6 220 aa10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 LILRA2Q8N149 483 aa10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 CHTF18Q8WVB6 975 aa10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 ST8SIA4Q92187 359 aa10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 MS4A4EQ96PG1 132 aa10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 SLC12A9Q9BXP2 914 aa10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 DZANK1Q9NVP4 752 aa10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 BOLA1Q9Y3E2 137 aa10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 A0A087WZY1 265 aa10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 K7ERQ8 282 aa10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 SPOCK1Q08629 439 aa10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 SLC7A6Q92536 515 aa10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 GGHQ92820 318 aa10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 SEC22AQ96IW7 307 aa10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 NARFLQ9H6Q4 476 aa10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 SPHK2Q9NRA0 654 aa10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 EHFQ9NZC4 300 aa10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 ANKRD12Q6UB98 2062 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 FABP7O15540 132 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 SFTPDP35247 375 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 MC3RP41968 323 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 FABP6P51161 128 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 EMP2P54851 167 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 B2MP61769 119 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 LTBQ06643 244 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 FIGLAQ6QHK4 219 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 USP53Q70EK8 1073 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 PRSS42Q7Z5A4 293 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 GLB1L2Q8IW92 636 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 CMIPQ8IY22 773 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 RDH10Q8IZV5 341 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 PNPLA1Q8N8W4 532 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 OR10Z1Q8NGY1 313 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 LPAR4Q99677 370 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 KCMF1Q9P0J7 381 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 LATO43561 262 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 LILRB3O75022 631 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 RAB40ALP0C0E4 278 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 ITGAMP11215 1152 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 SDC1P18827 310 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 HOXC5Q00444 222 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 ZNF789Q5FWF6 425 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 KDELC1Q6UW63 502 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 SERPINA11Q86U17 422 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 FAM213BQ8TBF2 198 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 RAB40AQ8WXH6 277 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 PLEK2Q9NYT0 353 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 TMEM82A0PJX8 343 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 IGLON5A6NGN9 336 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 AGAP14A8MT82 685 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 MSTNO14793 375 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 PPP1R2P9O14990 202 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 P04436 131 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 NME2P22392 152 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 OMGP23515 440 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 SPINT3P49223 89 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 NDUFA6P56556 154 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 TLE1Q04724 770 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 PLA2G7Q13093 441 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 ZNF691Q5VV52 312 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 SLC6A19Q695T7 634 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 LYPD4Q6UWN0 246 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 FAM122BQ7Z309 247 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 NPWQ8N729 165 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 PLPP5Q8NEB5 264 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 OR8J2Q8NGG1 315 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 MARVELD3Q96A59 401 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 BPIFA2Q96DR5 249 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 OR52D1Q9H346 318 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 SDK1Q7Z5N4 2213 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 A6NIZ1 184 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 GPR39O43194 453 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 MGST1P10620 155 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 RAP1BP61224 184 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 RAP1AP62834 184 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 ZNF91Q05481 1191 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 TCTE1Q5JU00 501 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 OR2G6Q5TZ20 316 aa10.05□□□□□ -0.8
PKNOX1-201ENST00000291547 COX15Q7KZN9 410 aa10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms