RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 VASNQ6EMK4 673 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 A3GALT2U3KPV4 340 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 CD300LBA8K4G0 201 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 HHLA1C9JL84 531 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 SOCS7O14512 581 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 WDSUB1Q8N9V3 476 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 KLHDC9Q8NEP7 349 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 POC1BQ8TC44 478 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 MYO10Q9HD67 2058 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 CPNE6O95741 557 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 RPS25P62851 125 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF546Q86UE3 836 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 CD163Q86VB7 1156 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 ACBD4Q8NC06 268 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 RADILQ96JH8 1075 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 HCAR1Q9BXC0 346 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD19PQ9H560 264 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 PRDM9Q9NQV7 894 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 URB1O60287 2271 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 EPHA1P21709 976 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 OR51Q1Q8NH59 317 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 TCTN2Q96GX1 697 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 CXorf36Q9H7Y0 433 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 B4DXG7 233 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 PRKAR1BP31321 381 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 EFNA3P52797 238 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 MBTPS1Q14703 1052 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 ACTBL2Q562R1 376 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 LAX1Q8IWV1 398 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF679Q8IYX0 411 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 PPA2Q9H2U2 334 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 NRIP3Q9NQ35 241 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 CD79AP11912 226 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 GABRR1P24046 479 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 ATP1B3P54709 279 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 PCBD1P61457 104 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 GIMAP1Q8WWP7 306 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 MALSU1Q96EH3 234 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 TAAR2Q9P1P5 351 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 KIF25Q9UIL4 384 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 MAOBP27338 520 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 PEA15Q15121 130 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 IL20RBQ6UXL0 311 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00299Q6ZSB3 139 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 RABEPKQ7Z6M1 372 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 OR5T1Q8NG75 326 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 CENPOQ9BU64 300 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 KATNB1Q9BVA0 655 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 SIAEQ9HAT2 523 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 ATG4BQ9Y4P1 393 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 C5P01031 1676 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 UBL3O95164 117 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 CAV3P56539 151 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 LILRB4Q8NHJ6 448 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 FCRL1Q96LA6 429 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 SSX3Q99909 188 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 RPS10P5Q9NQ39 176 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 TSPAN11A1L157 253 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 TAS2R46P59540 309 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 STEAP3Q658P3 488 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 MKXQ8IYA7 352 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 FAM174AQ8TBP5 190 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 C22orf15Q8WYQ4 148 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 DOT1LQ8TEK3 1739 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 AGPAT2O15120 278 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 GPR137BO60478 399 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 SLCO2B1O94956 709 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 OR8G3PP0DMU2 310 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 GJA4P35212 333 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 LTB4RQ15722 352 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 OPN5Q6U736 354 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 OR14A16Q8NHC5 309 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 ALG12Q9BV10 488 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A31Q9H0C2 315 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 COQ3Q9NZJ6 369 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 CD207Q9UJ71 328 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0D9SG52 128 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 ADAM23O75077 832 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 F13BP05160 661 aa19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.8 ms