RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 CCL4L1Q8NHW4 92 aa15.88■□□□□ 0.13
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TRPC1-201ENST00000273482 GABRB1P18505 474 aa15.86■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 LIM2P55344 173 aa15.86■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 GPR18Q14330 331 aa15.86■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 DECR1Q16698 335 aa15.86■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 C18orf63Q68DL7 685 aa15.86■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa15.86■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 SLC35F2Q8IXU6 374 aa15.86■□□□□ 0.13
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