RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269886.7

SH3GL1-201, Transcript of SH3 domain containing GRB2 like 1, endophilin A2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3GL1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL1-201ENST00000269886 OR2B3O76000 313 aa22.11■■□□□ 1.13
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SH3GL1-201ENST00000269886 GDI2P50395 445 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SH3GL1-201ENST00000269886 POU4F2Q12837 409 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3GL1-201ENST00000269886 TMEM92Q6UXU6 159 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3GL1-201ENST00000269886 LSMEM1Q8N8F7 131 aa22.11■■□□□ 1.13
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SH3GL1-201ENST00000269886 TEX19Q8NA77 164 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3GL1-201ENST00000269886 SPACA7Q96KW9 195 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3GL1-201ENST00000269886 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
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SH3GL1-201ENST00000269886 OR14A2Q96R54 314 aa22.1■■□□□ 1.13
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SH3GL1-201ENST00000269886 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
SH3GL1-201ENST00000269886 ERV3-1Q14264 604 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3GL1-201ENST00000269886 MTFR2Q6P444 385 aa22.09■■□□□ 1.13
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SH3GL1-201ENST00000269886 LYPD8Q6UX82 237 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3GL1-201ENST00000269886 RIT1Q92963 219 aa22.09■■□□□ 1.13
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SH3GL1-201ENST00000269886 PHF21AQ96BD5 680 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3GL1-201ENST00000269886 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SH3GL1-201ENST00000269886 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa22.09■■□□□ 1.13
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SH3GL1-201ENST00000269886 I3L1I5 382 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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SH3GL1-201ENST00000269886 SLC35F2Q8IXU6 374 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3GL1-201ENST00000269886 TOMM5Q8N4H5 51 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3GL1-201ENST00000269886 ZPLD1Q8TCW7 415 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3GL1-201ENST00000269886 SNX33Q8WV41 574 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3GL1-201ENST00000269886 ORAI1Q96D31 301 aa22.09■■□□□ 1.13
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SH3GL1-201ENST00000269886 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa22.08■■□□□ 1.13
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SH3GL1-201ENST00000269886 OR2T7P0C7T2 308 aa22.08■■□□□ 1.13
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SH3GL1-201ENST00000269886 OR2T27Q8NH04 317 aa22.08■■□□□ 1.13
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SH3GL1-201ENST00000269886 MED28Q9H204 178 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3GL1-201ENST00000269886 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SH3GL1-201ENST00000269886 ICAM5Q9UMF0 924 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3GL1-201ENST00000269886 COPS3Q9UNS2 423 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3GL1-201ENST00000269886 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa22.08■■□□□ 1.12
SH3GL1-201ENST00000269886 FLRT2O43155 660 aa22.08■■□□□ 1.12
SH3GL1-201ENST00000269886 SELENOFO60613 162 aa22.08■■□□□ 1.12
SH3GL1-201ENST00000269886 GPBAR1Q8TDU6 330 aa22.08■■□□□ 1.12
SH3GL1-201ENST00000269886 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
SH3GL1-201ENST00000269886 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.123e-7■■■■□ 19.8
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SH3GL1-201ENST00000269886 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
SH3GL1-201ENST00000269886 LRIT1Q9P2V4 623 aa22.08■■□□□ 1.12
SH3GL1-201ENST00000269886 DHFRP00374 187 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3GL1-201ENST00000269886 SERPINA3P01011 423 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3GL1-201ENST00000269886 TNFP01375 233 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3GL1-201ENST00000269886 SPTBP11277 2137 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3GL1-201ENST00000269886 GIFP27352 417 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3GL1-201ENST00000269886 YPEL5P62699 121 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3GL1-201ENST00000269886 FGFBP1Q14512 234 aa22.07■■□□□ 1.12
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