RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 POLE3Q9NRF9 147 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 C14orf105Q9NVL8 296 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 NTMQ9P121 344 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 C5AR2Q9P296 337 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CES1P1Q9UKY3 287 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM5Q9Y2B1 443 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CMAHPQ9Y471 501 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ATG4BQ9Y4P1 393 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CSAG2Q9Y5P2 127 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A0G2JN53 185 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 A6NJY4 79 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 OR5K4A6NMS3 321 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 M0R129 80 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 FMO6PO60774 539 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 B4GALT2O60909 372 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 RCBTB2O95199 551 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 HLA-DPB1P04440 258 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 KRT8P05787 483 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 DBIP07108 87 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CHRM4P08173 479 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 GAAP10253 952 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 FOLR1P15328 257 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 GALP22466 123 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CERS1P27544 350 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP6V1E1P36543 226 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 FEN1P39748 380 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 EPHA4P54764 986 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP3R1P63098 170 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAM1Q15629 374 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 GPR19Q15760 415 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SSX1Q16384 188 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 PDZK1Q5T2W1 519 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 DDI2Q5TDH0 399 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 STEAP3Q658P3 488 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 LCN10Q6JVE6 187 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF544Q6NX49 715 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 XKRXQ6PP77 449 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 ZER1Q7Z7L7 766 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CADM3Q8N126 398 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC43A2Q8N370 569 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 GDPD1Q8N9F7 314 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 MORN4Q8NDC4 146 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 OR2T33Q8NG76 320 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 OR6T1Q8NGN1 323 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 GRHL3Q8TE85 626 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC41A3Q96GZ6 507 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 HS6ST2Q96MM7 605 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SCN2AQ99250 2005 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 MCHR1Q99705 422 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SAP130Q9H0E3 1048 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC38A1Q9H2H9 487 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 KLHL31Q9H511 634 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRA2Q9H9E1 313 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 HHATLQ9HCP6 504 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SNTG1Q9NSN8 517 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CPNE7Q9UBL6 633 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 WDR45Q9Y484 360 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 RTTNQ86VV8 2226 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A087WUU8 490 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A087WV62 115 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAPPC13A5PLN9 417 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 LILRA5A6NI73 299 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 GLOD5A6NK44 160 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 TTC36A6NLP5 189 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 OR52A4PA6NMU1 304 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM227AF5H4B4 570 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 C19orf84I3L1E1 186 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 PGRMC2O15173 223 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 DYRK3O43781 588 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 PRKYO43930 277 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 TPST2O60704 377 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 COQ9O75208 318 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 STX11O75558 287 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 GPX5O75715 221 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CDRT1O95170 752 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 BMP7P18075 431 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 PAICSP22234 425 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
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