RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF117Q03924 483 aa14.19□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF385BQ569K4 471 aa14.19□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa14.19□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF527Q8NB42 609 aa14.19□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 OR52E4Q8NGH9 312 aa14.19□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF524Q96C55 264 aa14.19□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC58Q96CX6 371 aa14.19□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 FCRL1Q96LA6 429 aa14.19□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 DOK1Q99704 481 aa14.19□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 MMP27Q9H306 513 aa14.19□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 DCTN4Q9UJW0 460 aa14.19□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa14.18□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF716A6NP11 495 aa14.18□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 H6PDO95479 791 aa14.18□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 PRKCAP17252 672 aa14.18□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 NAA20P61599 178 aa14.18□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 LMO4P61968 165 aa14.18□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 IL1RL1Q01638 556 aa14.18□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 PDK3Q15120 406 aa14.18□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 C9orf135Q5VTT2 229 aa14.18□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 CLEC6AQ6EIG7 209 aa14.18□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa14.18□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 VHLLQ6RSH7 139 aa14.18□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 CNPY4Q8N129 248 aa14.18□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 OR2T11Q8NH01 316 aa14.18□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 RNF217Q8TC41 542 aa14.18□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 C22orf15Q8WYQ4 148 aa14.18□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 TLCD1Q96CP7 247 aa14.18□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 TREM2Q9NZC2 230 aa14.18□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 CORINQ9Y5Q5 1042 aa14.18□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 ACTL7BQ9Y614 415 aa14.18□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa14.17□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PQD3 144 aa14.17□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa14.17□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 TTC36A6NLP5 189 aa14.17□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 hCG_2039718K7EN88 272 aa14.17□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 PDPK1O15530 556 aa14.17□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 OIP5O43482 229 aa14.17□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 UROSP10746 265 aa14.17□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 SDC1P18827 310 aa14.17□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 SLC1A3P43003 542 aa14.17□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 HSPB3Q12988 150 aa14.17□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 ADRM1Q16186 407 aa14.17□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC153Q494R4 210 aa14.17□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 CBLN3Q6UW01 205 aa14.17□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 C1QL4Q86Z23 238 aa14.17□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 SYT14Q8NB59 555 aa14.17□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 GIMAP5Q96F15 307 aa14.17□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 DUX5Q96PT3 197 aa14.17□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 CCT7Q99832 543 aa14.17□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 KATNB1Q9BVA0 655 aa14.17□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 TUBB1Q9H4B7 451 aa14.17□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 EQTNQ9NQ60 294 aa14.17□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 OXSMQ9NWU1 459 aa14.17□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM129A0AVI4 362 aa14.16□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 TBX19O60806 448 aa14.16□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 CRCPO75575 148 aa14.16□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 PRSS23O95084 383 aa14.16□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 NKX2-2O95096 273 aa14.16□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 WNT11O96014 354 aa14.16□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 CRHR1P34998 444 aa14.16□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 FRKP42685 505 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 PRPS1P60891 318 aa14.16□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 PDE7AQ13946 482 aa14.16□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 PCLAFQ15004 111 aa14.16□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 CFAP157Q5JU67 520 aa14.16□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 RNF165Q6ZSG1 346 aa14.16□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa14.16□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 NANPQ8TBE9 248 aa14.16□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 GPR151Q8TDV0 419 aa14.16□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP14.16□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 SLC38A2Q96QD8 506 aa14.16□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 SLC52A3Q9NQ40 469 aa14.16□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 C1orf109Q9NX04 203 aa14.16□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 LGALS13Q9UHV8 139 aa14.16□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 ICAM5Q9UMF0 924 aa14.16□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 SEC22BO75396 215 aa14.15□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 ACP2P11117 423 aa14.15□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 CPA3P15088 417 aa14.15□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 MDKP21741 143 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 RBMXP38159 391 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 DIO1P49895 249 aa14.15□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 ZP4Q12836 540 aa14.15□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 SLC25A53Q5H9E4 307 aa14.15□□□□□ -0.14
SPCS1-201ENST00000233025 ELFN2Q5R3F8 820 aa14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms