RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227638.7

PANX1-201, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-201ENST00000227638 ALG11Q2TAA5 492 aa16.69■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 ZNF687Q8N1G0 1237 aa16.69■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 OR8H1Q8NGG4 311 aa16.69■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 TM4SF19Q96DZ7 209 aa16.69■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 CCDC120Q96HB5 630 aa16.69■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 LRIT1Q9P2V4 623 aa16.69■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 H7C1C5 153 aa16.68■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 OR10H2O60403 315 aa16.68■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 RPP14O95059 124 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 SMIM10L1P0DMW3 83 aa16.68■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 SLC6A1P30531 599 aa16.68■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 TALDO1P37837 337 aa16.68■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 LCN6P62502 163 aa16.68■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 SLC36A2Q495M3 483 aa16.68■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 TMEM255AQ5JRV8 349 aa16.68■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 GARNL3Q5VVW2 1013 aa16.68■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 NUDT18Q6ZVK8 323 aa16.68■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa16.68■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 ZNF524Q96C55 264 aa16.68■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 SMIM10Q96HG1 83 aa16.68■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 ANKRD19PQ9H560 264 aa16.68■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 GPANK1O95872 356 aa16.68■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 DBIP07108 87 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 MTNR1BP49286 362 aa16.68■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 PSG6Q00889 435 aa16.68■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 KCNAB1Q14722 419 aa16.68■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 PLA1AQ53H76 456 aa16.68■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 GID4Q8IVV7 300 aa16.68■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 GJD3Q8N144 294 aa16.68■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 AVL9Q8NBF6 648 aa16.68■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 OR4C3Q8NH37 302 aa16.68■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 PELI1Q96FA3 418 aa16.68■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa16.68■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 SARGQ9BW04 601 aa16.68■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 POT1Q9NUX5 634 aa16.68■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 CHP2O43745 196 aa16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 RPL4P36578 427 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 ERVK-25P63136 954 aa16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 ZSWIM7Q19AV6 140 aa16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 CDK20Q8IZL9 346 aa16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 KCNN2Q9H2S1 579 aa16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 MED17Q9NVC6 651 aa16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 PRELID1Q9Y255 219 aa16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 GPR89AB7ZAQ6 455 aa16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 PTP4A3O75365 173 aa16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 GPR75O95800 540 aa16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 WNT1P04628 370 aa16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 GPR89BP0CG08 455 aa16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 AHCYP23526 432 aa16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 RPS15P62841 145 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 POMZP3Q6PJE2 187 aa16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 TMEM92Q6UXU6 159 aa16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 CSNK1A1LQ8N752 337 aa16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 ZNF511Q8NB15 262 aa16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 NARFLQ9H6Q4 476 aa16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 ING3Q9NXR8 418 aa16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 PHF11Q9UIL8 331 aa16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 CACNG2Q9Y698 323 aa16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 FANCMQ8IYD8 2048 aa16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 ASXL3Q9C0F0 2248 aa16.67■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 BRINP1O60477 761 aa16.66■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 ST6GAL1P15907 406 aa16.66■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 PRKACBP22694 351 aa16.66■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 MAOBP27338 520 aa16.66■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 TCTE3Q8IZS6 198 aa16.66■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 DEFB119Q8N690 84 aa16.66■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 DNAAF1Q8NEP3 725 aa16.66■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 OR13H1Q8NG92 308 aa16.66■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 TMEM27Q9HBJ8 222 aa16.66■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa16.66■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa16.66■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 RAB3BP20337 219 aa16.66■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 MAOAP21397 527 aa16.66■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 SLC2A5P22732 501 aa16.66■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 ACSM1Q08AH1 577 aa16.66■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 C19orf57Q0VDD7 668 aa16.66■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 CA13Q8N1Q1 262 aa16.66■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 OR8K3Q8NH51 312 aa16.66■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 OR51Q1Q8NH59 317 aa16.66■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 WDR92Q96MX6 357 aa16.66■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 C2orf42Q9NWW7 574 aa16.66■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa16.66■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 TMEM5Q9Y2B1 443 aa16.66■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 RCBTB2O95199 551 aa16.66■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 WISP1O95388 367 aa16.66■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 GDI2P50395 445 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
PANX1-201ENST00000227638 Q6ZSR6 202 aa16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms