RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 PTGER1P34995 402 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 PCGF2P35227 344 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 PTGS2P35354 604 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 ALDH3B1P43353 468 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 ALDH3B2P48448 385 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 TNFRSF17Q02223 184 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 OR6F1Q8NGZ6 308 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 KCNE4Q8WWG9 221 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 SLC46A1Q96NT5 459 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 TSSK2Q96PF2 358 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 P2RY12Q9H244 342 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 MMP17Q9ULZ9 603 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 TRAV27A0A087WT01 109 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 ATP6V1G1O75348 118 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 TOXO94900 526 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 TSPAN15O95858 294 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 NFYBP25208 207 aa9.84□□□□□ -0.83
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TRPS1-201ENST00000220888 GK3PQ14409 553 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 SLC10A1Q14973 349 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 OR1Q1Q15612 314 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 OR7E24Q6IFN5 339 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 SBSNQ6UWP8 590 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 STK35Q8TDR2 534 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 PRDM9Q9NQV7 894 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 CLEC1BQ9P126 229 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 LOXL2Q9Y4K0 774 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 WASH4PA8MWX3 477 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 M0QZ24 198 aa9.84□□□□□ -0.83
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TRPS1-201ENST00000220888 PSMB10P40306 273 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 PLA2G7Q13093 441 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 SLC14A1Q13336 389 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 GALEQ14376 348 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 CNPY1Q3B7I2 92 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 LETMD1Q6P1Q0 360 aa9.84□□□□□ -0.83
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TRPS1-201ENST00000220888 SCML4Q8N228 414 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 SIRT6Q8N6T7 355 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 GOLM1Q8NBJ4 401 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 SHARPINQ9H0F6 387 aa9.84□□□□□ -0.83
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TRPS1-201ENST00000220888 C4orf47A7E2U8 309 aa9.84□□□□□ -0.83
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TRPS1-201ENST00000220888 CCR7P32248 378 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 TGM4P49221 684 aa9.84□□□□□ -0.83
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TRPS1-201ENST00000220888 OR2A12Q8NGT7 310 aa9.84□□□□□ -0.83
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TRPS1-201ENST00000220888 C3orf49Q96BT1 292 aa9.84□□□□□ -0.83
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TRPS1-201ENST00000220888 C1SP09871 688 aa9.83□□□□□ -0.84
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TRPS1-201ENST00000220888 AQP2P41181 271 aa9.83□□□□□ -0.84
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TRPS1-201ENST00000220888 SSUH2Q9Y2M2 353 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-201ENST00000220888 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
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TRPS1-201ENST00000220888 PTPN6P29350 595 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-201ENST00000220888 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-201ENST00000220888 CXCR4P61073 352 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-201ENST00000220888 AKR1C1Q04828 323 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-201ENST00000220888 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-201ENST00000220888 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-201ENST00000220888 GPR19Q15760 415 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-201ENST00000220888 EXD3Q8N9H8 876 aa9.83□□□□□ -0.84
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