RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Klf8Q8BLM0 355 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ubox5Q925F4 539 aa20.46■□□□□ 0.87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Prdm5Q9CXE0 599 aa20.46■□□□□ 0.87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Prl8a1Q9DAV8 240 aa20.46■□□□□ 0.87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmem43Q9DBS1 400 aa20.46■□□□□ 0.87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mocs2Q9Z223 189 aa20.46■□□□□ 0.87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dock6Q8VDR9 2080 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rasgef1aA0A0N4SVR5 498 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm13178B1AVU7 408 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Saxo1B1AXP3 476 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zfp945E9PYM8 794 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Olfr730E9Q8M3 318 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ms4a7E9Q9V5 267 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 MfngO09008 321 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Apoc3P33622 99 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 TesP47226 423 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tead3P70210 439 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc6a7Q6PGE7 637 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cadm2Q8BLQ9 435 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cpne1Q8C166 536 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 SinhcafQ8C8M1 221 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Coq9Q8K1Z0 313 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ubqln1Q8R317 582 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 TipinQ91WA1 278 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Papd4Q91YI6 484 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rassf1Q99MK9 340 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Steap1Q9CWR7 339 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hey1Q9WV93 299 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Phf3B2RQG2 2025 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm7929A0A286YDV3 213 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm21977F6U3N7 213 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm8247F6VRJ8 213 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm8005F6YKY3 213 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm3015F6ZAP6 213 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm8212F6ZMY5 213 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm7954F7BAX1 213 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm8138F7BY56 213 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm8232F7CFJ3 213 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm17079F7D8Y4 213 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm8165L7N218 213 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm8122L7N2C7 213 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm17078M0QW51 211 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Prl4a1O35256 227 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kcnk6Q3TBV4 313 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zfp791Q497V9 528 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Clcn4Q61418 747 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 ToxQ66JW3 526 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc25a40Q8BGP6 337 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Q8BHG2 160 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hist1h2aaQ8CGP4 129 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PiguQ8K358 434 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tsen15Q8R3W5 168 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc9a8Q8R4D1 576 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Olfr164Q8VF87 315 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Wdr45Q91VM3 360 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sntg1Q925E1 517 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam69bQ99ML4 431 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 4933436I01RikQ9D3T1 429 aa20.45■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 TomtA1Y9I9 258 aa20.44■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam209A2APA5 170 aa20.44■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm17067E9Q6S4 354 aa20.44■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fgf17P63075 216 aa20.44■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nkx3-2P97503 333 aa20.44■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Foxred1Q3TQB2 487 aa20.44■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Klhl21Q3U410 597 aa20.44■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Macrod2Q3UYG8 475 aa20.44■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atg4dQ8BGV9 474 aa20.44■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Anapc10Q8K2H6 185 aa20.44■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gipc3Q8R5M0 297 aa20.44■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 2410137M14RikQ9CWF0 162 aa20.44■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tnfrsf21Q9EPU5 655 aa20.44■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nox4Q9JHI8 578 aa20.44■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zfp68Q9Z116 606 aa20.44■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fcgr3P08508 261 aa20.44■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Grxcr2Q3TYR5 254 aa20.44■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 H2-Eb2Q3UUV9 287 aa20.44■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 HlxQ61670 476 aa20.44■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 IfnkQ7TSL0 199 aa20.44■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lkaaear1Q8BIG2 198 aa20.44■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Eipr1Q8K0G5 386 aa20.44■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gatad2bQ8VHR5 594 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dnmt3lQ9CWR8 421 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 C1qtnf2Q9D8U4 294 aa20.44■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 HnrnpdlQ9Z130 301 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Actl10A2AKE7 346 aa20.43■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Alx4O35137 399 aa20.43■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fer1l5P0DM40 2038 aa20.43■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Actr1aP61164 376 aa20.43■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rras2P62071 204 aa20.43■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Crmp1P97427 572 aa20.43■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 RykQ01887 594 aa20.43■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nhlrc4Q3UP44 136 aa20.43■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Efcab3Q80X60 432 aa20.43■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Actr1bQ8R5C5 376 aa20.43■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pafah2Q8VDG7 390 aa20.43■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc25a36Q922G0 311 aa20.43■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dmac2Q9D7K5 258 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Jph3Q9ET77 744 aa20.43■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Clec2iQ9WVF9 217 aa20.43■□□□□ 0.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pcdhgb8A0A140LI48 931 aa20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.1 ms