RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622020.4

NPHP4-211, Transcript of nephrocystin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NPHP4, Length 3,004 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4-211ENST00000622020 RELTQ969Z4 430 aa14.56□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 OTUB2Q96DC9 234 aa14.56□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 DNAJA3Q96EY1 480 aa14.56□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 MS4A4EQ96PG1 132 aa14.56□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 MAFFQ9ULX9 164 aa14.56□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 LINC00862A6NCI5 91 aa14.56□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 C4orf47A7E2U8 309 aa14.56□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa14.56□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 TSPAN9O75954 239 aa14.56□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 RPP14O95059 124 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 EDNRAP25101 427 aa14.56□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 LCN1P31025 176 aa14.56□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 RAD52P43351 418 aa14.56□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 GPR139Q6DWJ6 353 aa14.56□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 FCRLAQ7L513 359 aa14.56□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 OR5T3Q8NGG3 340 aa14.56□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 OR52I2Q8NH67 350 aa14.56□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 OR10G6Q8NH81 332 aa14.56□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 MOAP1Q96BY2 351 aa14.56□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 ANKRD19PQ9H560 264 aa14.56□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 DIABLOQ9NR28 239 aa14.56□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 HCN3Q9P1Z3 774 aa14.56□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 ZNF69Q9UC07 566 aa14.56□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 ACSL5Q9ULC5 683 aa14.56□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 RABL2BQ9UNT1 228 aa14.56□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 MED31Q9Y3C7 131 aa14.56□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 ADAM11O75078 769 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 IFNA7P01567 189 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 CTNNB1P35222 781 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 NNATQ16517 81 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 DCST2Q5T1A1 773 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 VN1R4Q7Z5H5 301 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 OR4K14Q8NGD5 310 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 PELI1Q96FA3 418 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 NANSQ9NR45 359 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 CA10Q9NS85 328 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 RCBTB2O95199 551 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 ZNF3P17036 446 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 GABRA3P34903 492 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 BDH1Q02338 343 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 RUNX2Q13950 521 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 TCTE1Q5JU00 501 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 SFRP5Q5T4F7 317 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 OTPQ5XKR4 325 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 APOOLQ6UXV4 268 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 SLC51BQ86UW2 128 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 OR2L8Q8NGY9 312 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 LCN9Q8WX39 176 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 NOX4Q9NPH5 578 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 TBX21Q9UL17 535 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 CA5BQ9Y2D0 317 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 MEIKINA0A087WXM9 373 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 SIX6O95475 246 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 MMP15P51511 669 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 COL28A1Q2UY09 1125 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 PXKQ7Z7A4 578 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 ASPGQ86U10 573 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 TPRA1Q86W33 373 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 OR11G2Q8NGC1 345 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 OR52B4Q8NGK2 314 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 CCL4L1Q8NHW4 92 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 C10orf90Q96M02 699 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 STARD5Q9NSY2 213 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa14.55□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 P2RX6O15547 441 aa14.54□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 SELENOFO60613 162 aa14.54□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 NGFRP08138 427 aa14.54□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 SULT1A3P0DMM9 295 aa14.54□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 SULT1A4P0DMN0 295 aa14.54□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 SOX2P48431 317 aa14.54□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 NRG3P56975 720 aa14.54□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 RPS15P62841 145 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 NDUFAF6Q330K2 333 aa14.54□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa14.54□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 BTN2A1Q7KYR7 527 aa14.54□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.54□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 ELMOD3Q96FG2 381 aa14.54□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa14.54□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 MGAT4CQ9UBM8 478 aa14.54□□□□□ -0.08
NPHP4-211ENST00000622020 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms