RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588178.5

PRKAR1A-213, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, human

TSL 4

Gene PRKAR1A, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKAR1A-213	ENST00000588178	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	ID2	Q02363	134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	OCA2	Q04671	838 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	TLE3	Q04726	772 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	CHRNE	Q04844	493 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	PIGF	Q07326	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	ST3GAL4	Q11206	333 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	TMED1	Q13445	227 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	AQP6	Q13520	282 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	DNASE1L3	Q13609	305 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	ZNF846	Q147U1	533 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	SPCS2	Q15005	226 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	PCOLCE	Q15113	449 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	TIGD6	Q17RP2	521 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	USP43	Q70EL4	1123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	SZRD1	Q7Z422	152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	LACC1	Q8IV20	430 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	CMIP	Q8IY22	773 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	GPR135	Q8IZ08	494 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	PIGX	Q8TBF5	258 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	OSTF1	Q92882	214 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	MR1	Q95460	341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	C8orf44	Q96CB5	159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	LGALS12	Q96DT0	336 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	TMEM80	Q96HE8	168 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	SDF2	Q99470	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	JAM3	Q9BX67	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	TEX12	Q9BXU0	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	HMG20A	Q9NP66	347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	TCFL5	Q9UL49	500 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	CDHR4	A6H8M9	788 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	IDS	B3KWA1	339 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	CLDN25	C9JDP6	229 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178		H3BN98	237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	STMND1	H3BQB6	276 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178		M0R3G1	203 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	CCRL2	O00421	344 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	PRODH	O43272	600 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	DDAH2	O95865	285 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	IGF2	P01344	180 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	PF4	P02776	101 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	IGKV3-11	P04433	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	LCK	P06239	509 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	GAA	P10253	952 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	COX6A1	P12074	109 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	CD36	P16671	472 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	NT5E	P21589	574 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	CD82	P27701	267 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKAR1A-213	ENST00000588178	DLST	P36957	453 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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