RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568477.5

CMTM3-215, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-215ENST00000568477 COX20Q5RI15 118 aa12.85□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 C22orf34Q6ZV56 151 aa12.85□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 GRINAQ7Z429 371 aa12.85□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 MIER2Q8N344 545 aa12.85□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 STEAP2Q8NFT2 490 aa12.85□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 PMM1Q92871 262 aa12.85□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 ITCHQ96J02 903 aa12.85□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 TMUB1Q9BVT8 246 aa12.85□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 CCDC106Q9BWC9 280 aa12.85□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 ACTR6Q9GZN1 396 aa12.85□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 OR10A4Q9H209 315 aa12.85□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 SAR1AQ9NR31 198 aa12.85□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 ARID1AO14497 2285 aa12.85□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 CLDN24A6NM45 220 aa12.84□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 SULT2B1O00204 365 aa12.84□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 ZCCHC18P0CG32 403 aa12.84□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 KLK2P20151 261 aa12.84□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 DIO1P49895 249 aa12.84□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 RIPPLY3P57055 190 aa12.84□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 PLAURQ03405 335 aa12.84□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa12.84□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 C6orf10Q5SRN2 563 aa12.84□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 EPGNQ6UW88 154 aa12.84□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 TMPPEQ6ZT21 453 aa12.84□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 WFDC8Q8IUA0 241 aa12.84□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 PEX5LQ8IYB4 626 aa12.84□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 OR9I1Q8NGQ6 314 aa12.84□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 WDR60Q8WVS4 1066 aa12.84□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 HS3ST6Q96QI5 342 aa12.84□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 PSD2Q9BQI7 771 aa12.84□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 HDHD5Q9BXW7 423 aa12.84□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 MYLK2Q9H1R3 596 aa12.84□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 UBTD1Q9HAC8 227 aa12.84□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 BCO1Q9HAY6 547 aa12.84□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 CTPS2Q9NRF8 586 aa12.84□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 SLC6A13Q9NSD5 602 aa12.84□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 P2RX2Q9UBL9 471 aa12.84□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 CHRNA9Q9UGM1 479 aa12.84□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 FREM1Q5H8C1 2179 aa12.84□□□□□ -0.35
CMTM3-215ENST00000568477 PRR14LQ5THK1 2151 aa12.83□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 FAM234BA2RU67 622 aa12.83□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 CYTIPO60759 359 aa12.83□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 DBIP07108 87 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 FESP07332 822 aa12.83□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 IL7RP16871 459 aa12.83□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 FPR1P21462 350 aa12.83□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 IL32P24001 234 aa12.83□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 LOXP28300 417 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 CRATP43155 626 aa12.83□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 HTR3AP46098 478 aa12.83□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 IDH2P48735 452 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 NR1H2P55055 460 aa12.83□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 STX1BP61266 288 aa12.83□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 KRT72Q14CN4 511 aa12.83□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 GABRG1Q8N1C3 465 aa12.83□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa12.83□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 TPT1P8Q9HAU6 139 aa12.83□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 TCF7L2Q9NQB0 619 aa12.83□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 CALML5Q9NZT1 146 aa12.83□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa12.83□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 CFAP73A6NFT4 308 aa12.82□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF724A8MTY0 619 aa12.82□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 AP3D1O14617 1153 aa12.82□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 KLF4O43474 513 aa12.82□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 ADAM11O75078 769 aa12.82□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 ETFAP13804 333 aa12.82□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 UQCRBP14927 111 aa12.82□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 OR3A2P47893 321 aa12.82□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 CLK1P49759 484 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 IDH3AP50213 366 aa12.82□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 MVDP53602 400 aa12.82□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 DSTNP60981 165 aa12.82□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 ADAM8P78325 824 aa12.82□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 P2RY6Q15077 328 aa12.82□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 ACKR1Q16570 336 aa12.82□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 GTDC1Q4AE62 458 aa12.82□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 METTL21CQ5VZV1 264 aa12.82□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa12.82□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 C20orf204Q6ZNR8 217 aa12.82□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF440Q8IYI8 595 aa12.82□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 PIGTQ969N2 578 aa12.82□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 VPS33AQ96AX1 596 aa12.82□□□□□ -0.36
CMTM3-215ENST00000568477 S100PBPQ96BU1 408 aa12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms