RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		19.33	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		19.33	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	19.33	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		19.33	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		19.33	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		19.33	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		19.33	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	CAD	P27708	2225 aa		19.32	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		19.32	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	19.32	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	19.32	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	EDNRA	P25101	427 aa		19.32	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC1A3	P43003	542 aa		19.32	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	HTR3A	P46098	478 aa		19.32	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	OR3A2	P47893	321 aa		19.32	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAM8	P78325	824 aa		19.32	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	EPS8	Q12929	822 aa		19.32	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	GNA13	Q14344	377 aa		19.32	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		19.32	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		19.32	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	19.32	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	S100PBP	Q96BU1	408 aa		19.32	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		19.32	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		19.32	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	RLIM	Q9NVW2	624 aa		19.32	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	19.32	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	19.32	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	CALML5	Q9NZT1	146 aa		19.32	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		19.32	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		19.32	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	CFAP73	A6NFT4	308 aa		19.31	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	19.31	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	DNPH1	O43598	174 aa		19.31	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	BCHE	P06276	602 aa		19.31	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	HOXC12	P31275	282 aa		19.31	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	CRISP3	P54108	245 aa		19.31	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	AQP5	P55064	265 aa		19.31	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	P2RY6	Q15077	328 aa		19.31	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	PDK3	Q15120	406 aa		19.31	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	RGN	Q15493	299 aa		19.31	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	BEX5	Q5H9J7	111 aa		19.31	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		19.31	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	HDX	Q7Z353	690 aa		19.31	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	19.31	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	VRK2	Q86Y07	508 aa		19.31	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		19.31	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		19.31	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		19.31	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		19.31	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		19.3	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF716	A6NP11	495 aa		19.3	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF208	O43345	1280 aa		19.3	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	TFPI	P10646	304 aa		19.3	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	BMP2	P12643	396 aa		19.3	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	CD99	P14209	185 aa		19.3	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	TACR3	P29371	465 aa		19.3	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	19.3	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	STX1B	P61266	288 aa		19.3	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	H3F3A	P84243	136 aa		19.3	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	TSC22D1	Q15714	1073 aa		19.3	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	ACKR1	Q16570	336 aa		19.3	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		19.3	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200		Q6ZT83	130 aa		19.3	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	19.3	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM19	Q96HH6	336 aa		19.3	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		19.3	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAM19	Q9H013	955 aa		19.3	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		19.3	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		19.3	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	PRSS50	Q9UI38	385 aa		19.3	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		19.3	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		19.3	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A096LPI6	279 aa		19.29	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	CLIC1	O00299	241 aa		19.29	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	ADA	P00813	363 aa		19.29	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	NUDT7	P0C024	238 aa		19.29	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	19.29	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	MAP2K6	P52564	334 aa		19.29	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP2R2A	P63151	447 aa		19.29	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	19.29	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	ITGAD	Q13349	1161 aa		19.29	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	LIN52	Q52LA3	116 aa		19.29	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	19.29	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF220	Q5VTB9	566 aa		19.29	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		19.29	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		19.29	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		19.29	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	PIP5K1A	Q99755	562 aa		19.29	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	DLL4	Q9NR61	685 aa		19.29	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	19.29	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		19.29	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	GMEB1	Q9Y692	573 aa		19.29	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0G2JPF8	293 aa		19.28	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM72	A0PK05	275 aa		19.28	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		19.28	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		19.28	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	19.28	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	THBS1	P07996	1170 aa		19.28	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	GKN3P	P0CG01	181 aa		19.28	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		19.28	■□□□□ 0.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84 ms