RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555894.5

TTC7B-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, human

TSL 3

Gene TTC7B, Length 738 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC7B-208	ENST00000555894	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	EMC3	Q9P0I2	261 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	AP3D1	O14617	1153 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	ARHGEF9	O43307	516 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	ADA	P00813	363 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	ETFA	P13804	333 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	CCNA2	P20248	432 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	HOXC12	P31275	282 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	OR3A2	P47893	321 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	CRISP3	P54108	245 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	ITGAD	Q13349	1161 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	SHE	Q5VZ18	495 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	VPS33A	Q96AX1	596 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	C7orf26	Q96N11	449 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	PIP5K1A	Q99755	562 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	NGB	Q9NPG2	151 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	CALML5	Q9NZT1	146 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	ARID1A	O14497	2285 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	FAM234B	A2RU67	622 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	TMEM247	A6NEH6	219 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	CFAP73	A6NFT4	308 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	ZNF724	A8MTY0	619 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	ADAM11	O75078	769 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	PMS2P2	O95744	297 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	BCHE	P06276	602 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	OR2B6	P58173	313 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	DSTN	P60981	165 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	GTDC1	Q4AE62	458 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	LIN52	Q52LA3	116 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	EPGN	Q6UW88	154 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894		Q6ZT83	130 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	HSD17B8	Q92506	261 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	DDIT4L	Q96D03	193 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	ARL5B	Q96KC2	179 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	PRSS50	Q9UI38	385 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	DNPH1	O43598	174 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	LYZL6	O75951	148 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	TGDS	O95455	350 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	FOSL1	P15407	271 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	TACR3	P29371	465 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	SLC1A3	P43003	542 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	MVD	P53602	400 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	EPS8	Q12929	822 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	TAB1	Q15750	504 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894		Q5PR19	223 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	VRK2	Q86Y07	508 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	PIGX	Q8TBF5	258 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	DLL4	Q9NR61	685 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	RLIM	Q9NVW2	624 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	DSCAM	O60469	2012 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	FAAH	O00519	579 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	GPR171	O14626	319 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	ZNF208	O43345	1280 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	PLAU	P00749	431 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	TFPT	P0C1Z6	253 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	PDK3	Q15120	406 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	MAPK11	Q15759	364 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	STK11	Q15831	433 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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