RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 NAXEQ8NCW5 288 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 OR5W2Q8NH69 310 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 MAL2Q969L2 176 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ZBTB8AQ96BR9 441 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 LAT2Q9GZY6 243 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 BRD7Q9NPI1 651 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 SAR1AQ9NR31 198 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 TMEM45AQ9NWC5 275 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 KLHL14Q9P2G3 628 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 P2RX2Q9UBL9 471 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 AP4B1Q9Y6B7 739 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 TMEM247A6NEH6 219 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 AGAP5A6NIR3 686 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 HSPB2A8KAH6 182 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 EVPLLA8MZ36 301 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 LINC01387J3KSC0 135 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 FBP2O00757 339 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 DYNC1I1O14576 645 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 TGM6O95932 706 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 PRKCAP17252 672 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 BMP5P22003 454 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 SFTPDP35247 375 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 TIMP3P35625 211 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 MAGEA8P43361 318 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ZNF136P52737 540 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CRISP3P54108 245 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 FOXF1Q12946 379 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 FOXF2Q12947 444 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 KLF10Q13118 480 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 SKP2Q13309 424 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CBFBQ13951 182 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 NFYCQ13952 458 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 QPRTQ15274 297 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 HSPB2Q16082 182 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 RUNDC3AQ59EK9 446 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 PPP4R4Q6NUP7 873 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 POMZP3Q6PJE2 187 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 P4HA3Q7Z4N8 544 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 VRK2Q86Y07 508 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 PEX5LQ8IYB4 626 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 LILRA2Q8N149 483 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 OR52P1PQ8NH57 321 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 WDR60Q8WVS4 1066 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 C10orf82Q8WW14 230 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 TMEM19Q96HH6 336 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 PINK1Q9BXM7 581 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 FAM107BQ9H098 131 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 RAD21L1Q9H4I0 556 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 IKZF5Q9H5V7 419 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 RLIMQ9NVW2 624 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CALML5Q9NZT1 146 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CLCF1Q9UBD9 225 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 STOML1Q9UBI4 398 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 EDARQ9UNE0 448 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 A0A0J9YW62 118 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 C5orf58C9J3I9 102 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 AP3D1O14617 1153 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 TNFSF11O14788 317 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ADAM11O75078 769 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 LY6G6DO95868 133 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 DBIP07108 87 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ZNF17P17021 662 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 GPX2P18283 190 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 PGCP20142 388 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 PPIBP23284 216 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CTSSP25774 331 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 SHC1P29353 583 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 GNALP38405 381 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 EIF1P41567 113 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 IDH2P48735 452 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 SESN3P58005 492 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 PLAURQ03405 335 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 FADDQ13158 208 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 SELPLGQ14242 412 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 MMEL1Q495T6 779 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 GCNT6Q5T4J0 391 aa8.63□□□□□ -1.03
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