RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MYO1GB0I1T2 1018 aa8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLDN34H7C241 214 aa8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 M0R233 179 aa8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SYNGR3O43761 229 aa8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NCR1O76036 304 aa8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SEC14L2O76054 403 aa8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLITRK5O94991 958 aa8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCNK2O95069 426 aa8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PSMG1O95456 288 aa8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LGI1O95970 557 aa8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NAT2P11245 290 aa8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SELEP16581 610 aa8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAD52P43351 418 aa8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FNTAP49354 379 aa8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RELBQ01201 579 aa8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HEPACAMQ14CZ8 416 aa8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PDK3Q15120 406 aa8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 QPRTQ15274 297 aa8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C3orf33Q6P1S2 294 aa8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRIG3Q6UXM1 1119 aa8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 REC114Q7Z4M0 266 aa8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF614Q8N883 585 aa8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FBXO36Q8NEA4 188 aa8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR4F6Q8NGB9 312 aa8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C16orf78Q8WTQ4 265 aa8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARL5BQ96KC2 179 aa8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF416Q9BWM5 594 aa8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MS4A5Q9H3V2 200 aa8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TCF7L1Q9HCS4 588 aa8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLEK2Q9NYT0 353 aa8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CMAHPQ9Y471 501 aa8.72□□□□□ -1.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLPSL1A2RUU4 121 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC188H7C350 402 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CYP7B1O75881 506 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRT33AO76009 404 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NKX2-2O95096 273 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV2-5P01817 119 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHN1P15882 459 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TSPAN8P19075 237 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GATA3P23771 443 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAE1P78406 368 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BTKQ06187 659 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C2orf80Q0P641 193 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NPRL3Q12980 569 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRAF3Q13114 568 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DAG1Q14118 895 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MSMPQ1L6U9 139 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PIGXQ8TBF5 258 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARL8AQ96BM9 186 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PHF21BQ96EK2 531 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHMP6Q96FZ7 201 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPR22Q99680 433 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBBP8Q99708 897 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM45AQ9NWC5 275 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PARPBPQ9NWS1 579 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NMRK1Q9NWW6 199 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VPS29Q9UBQ0 182 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1W2PQD3 144 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC151A5D8V7 595 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPP6CO00743 305 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RP2O75695 350 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACP2P11117 423 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRPS2P11908 318 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NTSP30990 170 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAGEA8P43361 318 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAGEB1P43366 347 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATP4BP51164 291 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2B6P58173 313 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MERTKQ12866 999 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HSPB3Q12988 150 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DUSP5Q16690 384 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VPS26BQ4G0F5 336 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SYT14P1Q58G82 188 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
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