RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513284.5

RNF4-218, Transcript of ring finger protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene RNF4, Length 517 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF4-218ENST00000513284 SPATA19Q7Z5L4 167 aa9.71□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 COX18Q8N8Q8 333 aa9.71□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 ARL8AQ96BM9 186 aa9.71□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 C16orf58Q96GQ5 468 aa9.71□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 CCT7Q99832 543 aa9.71□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 REEP4Q9H6H4 257 aa9.71□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 CA10Q9NS85 328 aa9.71□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 MALT1Q9UDY8 824 aa9.71□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 CARD8Q9Y2G2 431 aa9.71□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
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RNF4-218ENST00000513284 TMEM114B3SHH9 223 aa9.7□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 G3V2L1 256 aa9.7□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 H3BNH8 94 aa9.7□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 COPEO14579 308 aa9.7□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 TBX19O60806 448 aa9.7□□□□□ -0.86
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RNF4-218ENST00000513284 CPA3P15088 417 aa9.7□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 ATP6V1C1P21283 382 aa9.7□□□□□ -0.86
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RNF4-218ENST00000513284 MAPK1P28482 360 aa9.7□□□□□ -0.86
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RNF4-218ENST00000513284 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.86
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RNF4-218ENST00000513284 RNF165Q6ZSG1 346 aa9.7□□□□□ -0.86
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RNF4-218ENST00000513284 FBXO30Q8TB52 745 aa9.7□□□□□ -0.86
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RNF4-218ENST00000513284 JADE3Q92613 823 aa9.7□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 TMEM186Q96B77 213 aa9.7□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 APH1AQ96BI3 265 aa9.7□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 MTERF3Q96E29 417 aa9.7□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 CHMP6Q96FZ7 201 aa9.7□□□□□ -0.86
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RNF4-218ENST00000513284 HOXD1Q9GZZ0 328 aa9.7□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 SAP130Q9H0E3 1048 aa9.7□□□□□ -0.86
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RNF4-218ENST00000513284 LOC105371242A0A075B767 164 aa9.68□□□□□ -0.86
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RNF4-218ENST00000513284 VHLLQ6RSH7 139 aa9.68□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 UGT2A3Q6UWM9 527 aa9.68□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 ADAMTS15Q8TE58 950 aa9.68□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
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