RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496305.5

PHF20-215, Transcript of PHD finger protein 20, human

TSL 4

Gene PHF20, Length 588 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHF20-215	ENST00000496305		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	SEC22A	Q96IW7	307 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	RNF126	Q9BV68	326 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305		K7N7A8	449 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	ZNF208	O43345	1280 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	AP2A1	O95782	977 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	CD1E	P15812	388 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	AQP1	P29972	269 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	GRIA1	P42261	906 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	RIPK1	Q13546	671 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	VRK2	Q86Y07	508 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	OR56B4	Q8NH76	319 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	ST8SIA1	Q92185	356 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	EBF4	Q9BQW3	602 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	ZNF670	Q9BS34	389 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305		A0A1B0GUS0	222 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	PFKFB2	O60825	505 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	SNAPIN	O95295	136 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	COX5A	P20674	150 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	PKNOX1	P55347	436 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	NDP	Q00604	133 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	IL24	Q13007	206 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	CHIT1	Q13231	466 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	ZNF79	Q15937	498 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	UTS2B	Q765I0	119 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	TREM2	Q9NZC2	230 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	CDH9	Q9ULB4	789 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	MEMO1	Q9Y316	297 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305		A0A1B0GVY2	172 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	IDS	B3KWA1	339 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	GNA11	P29992	359 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	CALCR	P30988	508 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	RFC4	P35249	363 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	UGT1A5	P35504	534 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	EFNB2	P52799	333 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	AIF1	P55008	147 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	C1orf61	Q13536	156 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	KRT71	Q3SY84	523 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	CENPP	Q6IPU0	288 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	ZNF544	Q6NX49	715 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	KDELC1	Q6UW63	502 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	FTMT	Q8N4E7	242 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	LINC01006	Q8NI28	216 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	CLCC1	Q96S66	551 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	NPAS2	Q99743	824 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	PDF	Q9HBH1	243 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	SMOX	Q9NWM0	555 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	UGT1A9	O60656	530 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	MMP23A	O75900	390 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	ATP5L	O75964	103 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	ACTL6A	O96019	429 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	IGHV3-48	P01763	117 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	MAP3K8	P41279	467 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	BID	P55957	195 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	CSNK1G2	P78368	415 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	ASPH	Q12797	758 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	ARFRP1	Q13795	201 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74

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