RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	CDHR4	A6H8M9	788 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP8B1	O43520	1251 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	CYTIP	O60759	359 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	NTN1	O95631	604 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	GPI	P06744	558 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	FES	P07332	822 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	TACR3	P29371	465 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	NR1H2	P55055	460 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	CDK6	Q00534	326 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	EPS8	Q12929	822 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	NFYC	Q13952	458 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	P2RY6	Q15077	328 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	CDC20B	Q86Y33	519 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF217	Q8TC41	542 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	ABHD3	Q8WU67	409 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	ZG16B	Q96DA0	208 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF724	A8MTY0	619 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	SASH3	O75995	380 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	PGM3	O95394	542 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	AHSA1	O95433	338 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	CGA	P01215	116 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	BMP2	P12643	396 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	FPR1	P21462	350 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	HOXC12	P31275	282 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	PRKAR1B	P31321	381 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	IDUA	P35475	653 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	RBBP4	Q09028	425 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	SCARB2	Q14108	478 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	PDK3	Q15120	406 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	GTDC1	Q4AE62	458 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	BEX5	Q5H9J7	111 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	VRK2	Q86Y07	508 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	HIPK4	Q8NE63	616 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	ELOA3	Q8NG57	546 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	NFKBID	Q8NI38	313 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	APH1A	Q96BI3	265 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	MUCL1	Q96DR8	90 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	NPAS1	Q99742	590 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	BCO1	Q9HAY6	547 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	GID8	Q9NWU2	228 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	UPB1	Q9UBR1	384 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	CLDN24	A6NM45	220 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246		A8MVM7	634 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	EFNA2	O43921	213 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	KRT33A	O76009	404 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	NPPA	P01160	153 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	IFNA14	P01570	189 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	RAF1	P04049	648 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	GKN3P	P0CG01	181 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	ARAF	P10398	606 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	PNMT	P11086	282 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	CRYGS	P22914	178 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-231	ENST00000496246	SHC1	P29353	583 aa		10.1	□□□□□ -0.79

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