RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494136.1

LAMTOR4-212, Transcript of late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 4, humanhuman

TSL 2

Gene LAMTOR4, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR4-212ENST00000494136 BCL2L10Q9HD36 194 aa7.56□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 CTPS2Q9NRF8 586 aa7.56□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 ZNF446Q9NWS9 450 aa7.56□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 TMED7Q9Y3B3 224 aa7.56□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 GMEB1Q9Y692 573 aa7.56□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 CREBBPQ92793 2442 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 A0A1W2PNR3 127 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 CLDN24A6NM45 220 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 AP3D1O14617 1153 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 SLC22A2O15244 555 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 PGM3O95394 542 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 NPPAP01160 153 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 FESP07332 822 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 YES1P07947 543 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 GPX2P18283 190 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 IL11P20809 199 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 IL32P24001 234 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 SHC1P29353 583 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 TACR3P29371 465 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 PRKAR1BP31321 381 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 IDUAP35475 653 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 UGT2B10P36537 528 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 MDH1P40925 334 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 SLC35A1P78382 337 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 GUCY1A3Q02108 690 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 GUSBP1Q15486 140 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 COQ5Q5HYK3 327 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 PAGE3Q5JUK9 113 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 C5orf46Q6UWT4 87 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 TMPPEQ6ZT21 453 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 SSX8Q7RTT4 187 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 VRK2Q86Y07 508 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 ARMC8Q8IUR7 673 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 CADM2Q8N3J6 435 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 NFKBIDQ8NI38 313 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 ABHD3Q8WU67 409 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 RASSF5Q8WWW0 418 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 ROBO4Q8WZ75 1007 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 CGREF1Q99674 301 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 SRXN1Q9BYN0 137 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 KLHL4Q9C0H6 718 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 C12orf49Q9H741 205 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 BCO1Q9HAY6 547 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 NGBQ9NPG2 151 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 VAPAQ9P0L0 249 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 TMEM181Q9P2C4 612 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 KLHL14Q9P2G3 628 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 CLEC4AQ9UMR7 237 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 TRAPPC4Q9Y296 219 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 TESMINQ9Y4I5 508 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 CAPN7Q9Y6W3 813 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 MYO9AB2RTY4 2548 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 TEX15Q9BXT5 2789 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 APCP25054 2843 aa7.55□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa7.54□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 ZNF724A8MTY0 619 aa7.54□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 CYTIPO60759 359 aa7.54□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 CCDC22O60826 627 aa7.54□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 CTAG2O75638 210 aa7.54□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 AHSA1O95433 338 aa7.54□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 GPIP06744 558 aa7.54□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 CCNA2P20248 432 aa7.54□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 OR2B6P58173 313 aa7.54□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 PDK3Q15120 406 aa7.54□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 ELOA3BQ3SY89 546 aa7.54□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa7.54□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa7.54□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 ARPINQ7Z6K5 226 aa7.54□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 GALNT5Q7Z7M9 940 aa7.54□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 ZNF100Q8IYN0 542 aa7.54□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 ZNF610Q8N9Z0 462 aa7.54□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 STEAP2Q8NFT2 490 aa7.54□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 ELOA3Q8NG57 546 aa7.54□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 SLC26A7Q8TE54 656 aa7.54□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 NINJ1Q92982 152 aa7.54□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 MAL2Q969L2 176 aa7.54□□□□□ -1.2
LAMTOR4-212ENST00000494136 ZG16BQ96DA0 208 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms