RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 IL12AP29459 219 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 PGM1P36871 562 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 CDKN1AP38936 164 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 MAGEA8P43361 318 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 PTH2RP49190 550 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF83P51522 516 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 WDR4P57081 412 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 C21orf58P58505 322 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 BSPH1Q075Z2 132 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 FUT5Q11128 374 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ITGADQ13349 1161 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 VEZF1Q14119 521 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 GNA13Q14344 377 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 PPA1Q15181 289 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 COX20Q5RI15 118 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 CASP12Q6UXS9 341 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 FRRS1Q6ZNA5 592 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 TMPPEQ6ZT21 453 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC103Q8IW40 242 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 PEX5LQ8IYB4 626 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 GABRG1Q8N1C3 465 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 KBTBD8Q8NFY9 601 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 RNF217Q8TC41 542 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 HSD17B8Q92506 261 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 FBXW5Q969U6 566 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 APH1AQ96BI3 265 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 TESCQ96BS2 214 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 NEURL3Q96EH8 262 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ARL5BQ96KC2 179 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC115Q96NT0 180 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 PSD2Q9BQI7 771 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ALG2Q9H553 416 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 AIG1Q9NVV5 245 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 THAP1Q9NVV9 213 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 UPB1Q9UBR1 384 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 TMED7Q9Y3B3 224 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 CSPG4Q6UVK1 2322 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 JMJD1CQ15652 2540 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM72A0PK05 275 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 CFAP73A6NFT4 308 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF814B7Z6K7 855 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 M0R1B8 84 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 UBDO15205 165 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 CYTIPO60759 359 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 RAMP1O60894 148 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 KRT33AO76009 404 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 KRT75O95678 551 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 BCHEP06276 602 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 CHRM4P08173 479 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ETFAP13804 333 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 GGT1P19440 569 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 IGHV1-2P23083 117 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 EDNRAP25101 427 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 LOXP28300 417 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 TACR3P29371 465 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 OR3A2P47893 321 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 PCYT1AP49585 367 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 COPZ1P61923 177 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 PPP2R2BQ00005 443 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 IL1RL1Q01638 556 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 BNIP2Q12982 314 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 P2RY6Q15077 328 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 SLC22A25Q6T423 547 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 Q6ZT83 130 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 GRINAQ7Z429 371 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 GPAT4Q86UL3 456 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 VRK2Q86Y07 508 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 MIPOL1Q8TD10 442 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 DYDC1Q8WWB3 177 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 VPS33AQ96AX1 596 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 DDIT4LQ96D03 193 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 RADILQ96JH8 1075 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 PIP5K1AQ99755 562 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC106Q9BWC9 280 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 POTEKPQ9BYX7 375 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 RMND5AQ9H871 391 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 DLL4Q9NR61 685 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 POLE3Q9NRF9 147 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 RLIMQ9NVW2 624 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ADPRHL2Q9NX46 363 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM181Q9P2C4 612 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 BTNL2Q9UIR0 455 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 RAB21Q9UL25 225 aa7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms