RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 GANABQ14697 944 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 SLC36A3Q495N2 470 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 FGD3Q5JSP0 725 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 FNDC7Q5VTL7 733 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 KRT80Q6KB66 452 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 PODNL1Q6PEZ8 512 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 GDF7Q7Z4P5 450 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
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SHQ1-207ENST00000475558 SLC7A13Q8TCU3 470 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 PAQR8Q8TEZ7 354 aa6.4□□□□□ -1.38
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SHQ1-207ENST00000475558 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 OSTF1Q92882 214 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 HGDQ93099 445 aa6.4□□□□□ -1.38
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SHQ1-207ENST00000475558 C5orf34Q96MH7 638 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 Q96MT0 163 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 FRMD6Q96NE9 622 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 AGAP4Q96P64 663 aa6.4□□□□□ -1.38
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SHQ1-207ENST00000475558 UCK2Q9BZX2 261 aa6.4□□□□□ -1.38
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SHQ1-207ENST00000475558 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 METTL7AQ9H8H3 244 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 KRT84Q9NSB2 600 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 RLIMQ9NVW2 624 aa6.4□□□□□ -1.38
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SHQ1-207ENST00000475558 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 KLRF1Q9NZS2 232 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 KCNE5Q9UJ90 142 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 FBXL4Q9UKA2 621 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 ICAM5Q9UMF0 924 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 BAIAP2Q9UQB8 552 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 DTX4Q9Y2E6 619 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 LRBAP50851 2863 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 POLQO75417 2590 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 SEC16AO15027 2179 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 POLEQ07864 2286 aa6.39□□□□□ -1.39
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SHQ1-207ENST00000475558 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 ARGFXA6NJG6 315 aa6.39□□□□□ -1.39
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SHQ1-207ENST00000475558 GJE1A6NN92 205 aa6.39□□□□□ -1.39
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SHQ1-207ENST00000475558 FFAR1O14842 300 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF208O43345 1280 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 ICOSLGO75144 302 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 CEACAM4O75871 244 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 EPPINO95925 133 aa6.39□□□□□ -1.39
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SHQ1-207ENST00000475558 GASTP01350 101 aa6.39□□□□□ -1.39
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SHQ1-207ENST00000475558 HIST1H2ABP04908 130 aa6.39□□□□□ -1.39
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SHQ1-207ENST00000475558 CBLP22681 906 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 FPR3P25089 353 aa6.39□□□□□ -1.39
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SHQ1-207ENST00000475558 DAPP51397 102 aa6.39□□□□□ -1.39
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SHQ1-207ENST00000475558 PRPS1P60891 318 aa6.39□□□□□ -1.39
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SHQ1-207ENST00000475558 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM44Q2T9K0 475 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 SLC25A53Q5H9E4 307 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 ALG10BQ5I7T1 473 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 C1QL3Q5VWW1 255 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 ISLR2Q6UXK2 745 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 GRINAQ7Z429 371 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 GALNT10Q86SR1 603 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 MARCH3Q86UD3 253 aa6.39□□□□□ -1.39
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