RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469336.1

UBE3C-204, Transcript of ubiquitin protein ligase E3C, humanhuman

TSL 2

Gene UBE3C, Length 655 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3C-204ENST00000469336 LGI1O95970 557 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 C1QBP02746 253 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 FTH1P02794 183 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 CD1DP15813 335 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 CTRB1P17538 263 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 PRKACBP22694 351 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 IL32P24001 234 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 EPHA2P29317 976 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 CHRNA7P36544 502 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 OR3A3P47888 321 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 OR4D2P58180 307 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 VBP1P61758 197 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 GALK2Q01415 458 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 TSPY1Q01534 308 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 SCN1BQ07699 218 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP4.96□□□□□ -1.622e-6■■□□□ 13.5
UBE3C-204ENST00000469336 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 MAPK11Q15759 364 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 LRRC26Q2I0M4 334 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 PARP15Q460N3 678 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 HSD17B12Q53GQ0 312 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 RNLSQ5VYX0 342 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 LRRC66Q68CR7 880 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 CTRB2Q6GPI1 263 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 NEK5Q6P3R8 708 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 CORO6Q6QEF8 472 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 SPESP1Q6UW49 350 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 IL27RAQ6UWB1 636 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 FAM92BQ6ZTR7 304 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 PIGZQ86VD9 579 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 NUDT13Q86X67 352 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 FAM131BQ86XD5 332 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 MFSD6LQ8IWD5 586 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 ELMOD2Q8IZ81 293 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 DEFB106AQ8N104 65 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 GDPD1Q8N9F7 314 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 NPEPL1Q8NDH3 523 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 ZNF540Q8NDQ6 660 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 DENND6BQ8NEG7 585 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 OR56A4Q8NGH8 313 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 OR1J1Q8NGS3 322 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 OR10T2Q8NGX3 314 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 GRHL3Q8TE85 626 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 HSD17B8Q92506 261 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 SPSB1Q96BD6 273 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 RNF170Q96K19 258 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 ZNF354BQ96LW1 612 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 PPP3R2Q96LZ3 170 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 ATOH8Q96SQ7 321 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 FEVQ99581 238 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 EGFL8Q99944 293 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 RTP3Q9BQQ7 232 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 SLC30A2Q9BRI3 323 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 GABARAPL3Q9BY60 117 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 DUSP16Q9BY84 665 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 CCDC90BQ9GZT6 254 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 MID1IP1Q9NPA3 183 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 FBXL12Q9NXK8 326 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 SPHK1Q9NYA1 384 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 IL37Q9NZH6 218 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 ICAM5Q9UMF0 924 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 GMPPBQ9Y5P6 360 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 AUP1Q9Y679 476 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 MICAL3Q7RTP6 2002 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 SCN9AQ15858 1988 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 MEIOCA2RUB1 952 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 LINC00862A6NCI5 91 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 EFCAB10A6NFE3 127 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 ASB14A6NK59 587 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 YDJCA8MPS7 323 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 CXCR6O00574 342 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 SEMA3DO95025 777 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 EPOP01588 193 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 MT-ND2P03891 347 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 CDK1P06493 297 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 ODC1P11926 461 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 PIPP12273 146 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 LIFP15018 202 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 CD22P20273 847 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 CPN2P22792 545 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 PSMA3P25788 255 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 LHX1P48742 406 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 MAPK12P53778 367 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 NCS1P62166 190 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 LGALS3BPQ08380 585 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 RAPSNQ13702 412 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 GRB7Q14451 532 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE3C-204ENST00000469336 ZNF273Q14593 569 aa4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms