RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 FAM171A2A8MVW0 826 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 C9JVG2 144 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 GPR171O14626 319 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 UBDO15205 165 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF208O43345 1280 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 TGDSO95455 350 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ANP32DO95626 131 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 GSNP06396 782 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 DBIP07108 87 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 FESP07332 822 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 CHRM4P08173 479 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 UQCRBP14927 111 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 PAX1P15863 534 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 IL7RP16871 459 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 CDKN2CP42773 168 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 SLC1A3P43003 542 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 FUT5Q11128 374 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 COX20Q5RI15 118 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 AGBL2Q5U5Z8 902 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 EPGNQ6UW88 154 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 BIVMQ86UB2 503 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 P2RY8Q86VZ1 359 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 WFDC8Q8IUA0 241 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 PEX5LQ8IYB4 626 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF100Q8IYN0 542 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF611Q8N823 705 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ANKFN1Q8N957 763 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 WFDC11Q8NEX6 87 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 S100PBPQ96BU1 408 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 C18orf12Q96KH6 178 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 CCL19Q99731 98 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 BDH2Q9BUT1 245 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ADAM19Q9H013 955 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 EMC3Q9P0I2 261 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM181Q9P2C4 612 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 TMED7Q9Y3B3 224 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ZANQ9Y493 2812 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 RTTNQ86VV8 2226 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ABCA1O95477 2261 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 A0A0G2JPF8 293 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 FAM234BA2RU67 622 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM247A6NEH6 219 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 CFAP73A6NFT4 308 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 CLDN24A6NM45 220 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 HS3ST1O14792 307 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 DIAPH2O60879 1101 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 PGM3O95394 542 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 PLAUP00749 431 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 C1QCP02747 245 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 CD3EP07766 207 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 INHBBP09529 407 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 TFPTP0C1Z6 253 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 CRATP43155 626 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 SLC16A1P53985 500 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 OR2B6P58173 313 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 SLC35A1P78382 337 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 H3F3AP84243 136 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 EPS8Q12929 822 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 TAB1Q15750 504 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 TIMM23BQ5SRD1 257 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 NCMAPQ5T1S8 102 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 FBXW9Q5XUX1 488 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 MIER2Q8N344 545 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 OR52P1PQ8NH57 321 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 PIGXQ8TBF5 258 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM171Q8WVE6 324 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 WDR60Q8WVS4 1066 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 IGFBPL1Q8WX77 278 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 DDIT4LQ96D03 193 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 MUCL1Q96DR8 90 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ARL5BQ96KC2 179 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 OR52B2Q96RD2 323 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 POTEKPQ9BYX7 375 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 GSX2Q9BZM3 304 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 RAD21L1Q9H4I0 556 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 CXorf56Q9H5V9 222 aa6.45□□□□□ -1.38
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