RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452576.6

VWDE-203, Transcript of von Willebrand factor D and EGF domains, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWDE, Length 5,936 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDE-203ENST00000452576 C1orf123Q9NWV4 160 aa11.49□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 SLC31A2O15432 143 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 KCNK2O95069 426 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 RABIFP47224 123 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 GRB2P62993 217 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 CATR1Q13166 79 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 GPR18Q14330 331 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 TRIM61Q5EBN2 209 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 FCRLAQ7L513 359 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 FAM122AQ96E09 287 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 SLC17A9Q9BYT1 436 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 MCOLN1Q9GZU1 580 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 OR52A5Q9H2C5 316 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 OPA3Q9H6K4 179 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 SFXN1Q9H9B4 322 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 IGSF5Q9NSI5 407 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 TNFRSF10AO00220 468 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 CLDN1O95832 211 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 BMP1P13497 986 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 HACD4Q5VWC8 232 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 LETMD1Q6P1Q0 360 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 OR2M2Q96R28 347 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 NIPAL2Q9H841 368 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 ELOVL3Q9HB03 270 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 GABARAPH6UMI1 98 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 GABARAPO95166 117 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 FCGR2AP12318 317 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 ITGB8P26012 769 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 TACR3P29371 465 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 PHYHD1Q5SRE7 291 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 AVPI1Q5T686 147 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 SLC6A19Q695T7 634 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 OR7E24Q6IFN5 339 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 HSD17B8Q92506 261 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 FAM173AQ9BQD7 235 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 GNB4Q9HAV0 340 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP11.48□□□□□ -0.571e-7■■■□□ 17.9
VWDE-203ENST00000452576 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 BCL9LQ86UU0 1499 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 LRP5LA4QPB2 252 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 FAM183AA6NL82 134 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 RAB27BO00194 218 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 ANGPTL7O43827 346 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 GM2AP17900 193 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 C5AR1P21730 350 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 MAOBP27338 520 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 HMGN3Q15651 99 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 OR2T27Q8NH04 317 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 SEC22AQ96IW7 307 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 STEAP1Q9UHE8 339 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 ZNF337Q9Y3M9 751 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 TMEM82A0PJX8 343 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 GPR32O75388 356 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 SEMA4FO95754 770 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 ABOP16442 354 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 ILKQ13418 452 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 IKZF1Q13422 519 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 OR52H1Q8NGJ2 320 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 TMEM163Q8TC26 289 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 PISDQ9UG56 409 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 BTNL2Q9UIR0 455 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 Q9Y3F1 56 aa11.48□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 I3L1I5 382 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 IL32P24001 234 aa11.47□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 PAX6P26367 422 aa11.47□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 GSK3AP49840 483 aa11.47□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 RPL11P62913 178 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 MS4A2Q01362 244 aa11.47□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 ADIRFQ15847 76 aa11.47□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa11.47□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 OR10K1Q8NGX5 313 aa11.47□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 SECTM1Q8WVN6 248 aa11.47□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 RNF170Q96K19 258 aa11.47□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 LURAP1Q96LR2 239 aa11.47□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 ZNF778Q96MU6 729 aa11.47□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 MACROD1Q9BQ69 325 aa11.47□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 DMRT3Q9NQL9 472 aa11.47□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 MTCH1Q9NZJ7 389 aa11.47□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 STC2O76061 302 aa11.47□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 TNFSF8P32971 234 aa11.47□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 CLINT1Q14677 625 aa11.47□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 RAB35Q15286 201 aa11.47□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 SSX9Q7RTT3 188 aa11.47□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 TMEM217Q8N7C4 229 aa11.47□□□□□ -0.57
VWDE-203ENST00000452576 OR5H6Q8NGV6 325 aa11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms