RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419364.1

SIX3-AS1-201, SIX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SIX3-AS1, Length 844 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3-AS1-201ENST00000419364 Q6ZT83 130 aa11.86□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ADGRG3Q86Y34 549 aa11.86□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 P3H2Q8IVL5 708 aa11.86□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF440Q8IYI8 595 aa11.86□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa11.86□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 WFDC11Q8NEX6 87 aa11.86□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HSD17B8Q92506 261 aa11.86□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PLPPR2Q96GM1 343 aa11.86□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ARL5BQ96KC2 179 aa11.86□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 C7orf26Q96N11 449 aa11.86□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TPT1P8Q9HAU6 139 aa11.86□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NGBQ9NPG2 151 aa11.86□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 EMC3Q9P0I2 261 aa11.86□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa11.85□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TMEM247A6NEH6 219 aa11.85□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CFAP73A6NFT4 308 aa11.85□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FAAHO00519 579 aa11.85□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 AP3D1O14617 1153 aa11.85□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DNPH1O43598 174 aa11.85□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ADAM11O75078 769 aa11.85□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TGDSO95455 350 aa11.85□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CCNA2P20248 432 aa11.85□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MAP2K6P52564 334 aa11.85□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MVDP53602 400 aa11.85□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CRISP3P54108 245 aa11.85□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 OR2B6P58173 313 aa11.85□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DSTNP60981 165 aa11.85□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 STX1BP61266 288 aa11.85□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa11.85□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GALNT5Q7Z7M9 940 aa11.85□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF100Q8IYN0 542 aa11.85□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 OR9I1Q8NGQ6 314 aa11.85□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PIGXQ8TBF5 258 aa11.85□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LRRC8CQ8TDW0 803 aa11.85□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 VPS33AQ96AX1 596 aa11.85□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DDIT4LQ96D03 193 aa11.85□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa11.85□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 OR11A1Q9GZK7 315 aa11.85□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DLL4Q9NR61 685 aa11.85□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PRSS50Q9UI38 385 aa11.85□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PRDM4Q9UKN5 801 aa11.85□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TRAPPC4Q9Y296 219 aa11.85□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TMED7Q9Y3B3 224 aa11.85□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa11.85□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HIVEP1P15822 2718 aa11.85□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa11.84□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GPR171O14626 319 aa11.84□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF208O43345 1280 aa11.84□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PLAUP00749 431 aa11.84□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 BCHEP06276 602 aa11.84□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TFPTP0C1Z6 253 aa11.84□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TACR3P29371 465 aa11.84□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SLC1A3P43003 542 aa11.84□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 EPS8Q12929 822 aa11.84□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MAPK11Q15759 364 aa11.84□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZSWIM7Q19AV6 140 aa11.84□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GTDC1Q4AE62 458 aa11.84□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LIN52Q52LA3 116 aa11.84□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa11.84□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 OR52P1PQ8NH57 321 aa11.84□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SLC38A5Q8WUX1 472 aa11.84□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GTF2H4Q92759 462 aa11.84□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DNAJA3Q96EY1 480 aa11.84□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TMEM204Q9BSN7 226 aa11.84□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 POTEKPQ9BYX7 375 aa11.84□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TCF7L2Q9NQB0 619 aa11.84□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RLIMQ9NVW2 624 aa11.84□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TMEM181Q9P2C4 612 aa11.84□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 OSGIN1Q9UJX0 560 aa11.84□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF232Q9UNY5 417 aa11.84□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DSPPQ9NZW4 1301 aa11.84□□□□□ -0.51
SIX3-AS1-201ENST00000419364 A0A0G2JPF8 293 aa11.83□□□□□ -0.52
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CDHR4A6H8M9 788 aa11.83□□□□□ -0.52
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa11.83□□□□□ -0.52
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa11.83□□□□□ -0.52
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HS3ST1O14792 307 aa11.83□□□□□ -0.52
SIX3-AS1-201ENST00000419364 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LYZL6O75951 148 aa11.83□□□□□ -0.52
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa11.83□□□□□ -0.52
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
SIX3-AS1-201ENST00000419364 IDH3AP50213 366 aa11.83□□□□□ -0.52
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SLC35A1P78382 337 aa11.83□□□□□ -0.52
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TAB1Q15750 504 aa11.83□□□□□ -0.52
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SLC2A7Q6PXP3 512 aa11.83□□□□□ -0.52
SIX3-AS1-201ENST00000419364 VRK2Q86Y07 508 aa11.83□□□□□ -0.52
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DYDC1Q8WWB3 177 aa11.83□□□□□ -0.52
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms