RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411092.1

RNU6-55P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 55, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-55P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-55P-201ENST00000411092 GABRPO00591 440 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 NPC1O15118 1278 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 CTDSPLO15194 276 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 LRRTM2O43300 516 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF749O43361 778 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 CHP2O43745 196 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 TSPAN3O60637 253 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 UBL3O95164 117 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 C1orf105O95561 183 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 ETHE1O95571 254 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 FGF19O95750 216 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 WDPCPO95876 746 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 AGR2O95994 175 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 SERPINA3P01011 423 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 FGBP02675 491 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 RAF1P04049 648 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 SERPIND1P05546 499 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 URODP06132 367 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 BCHEP06276 602 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 GALTP07902 379 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 FHP07954 510 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 IL3P08700 152 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 ADRA2AP08913 450 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 POU2F2P09086 479 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 DUX4L2P0CJ85 424 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 DUX4L3P0CJ86 424 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 DUX4L4P0CJ87 422 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 DUX4L5P0CJ88 424 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 DUX4L6P0CJ89 424 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 DUX4L7P0CJ90 424 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 LIMS3P0CW19 117 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 LIMS4P0CW20 117 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 CTSAP10619 480 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 IRF1P10914 325 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 POU2F1P14859 743 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 NPPBP16860 134 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 TNFRSF1BP20333 461 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 NPR2P20594 1047 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 CERS1P27544 350 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 HTR1FP30939 366 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 NTSP30990 170 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 OR1D2P34982 312 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 ETV5P41161 510 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC1A3P43003 542 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 PITPNBP48739 271 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 ETV1P50549 477 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 MAPK12P53778 367 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 GAS1P54826 345 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 CDH11P55287 796 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 AP3S2P59780 193 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 RAB14P61106 215 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 RPS25P62851 125 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZXDBP98169 803 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 FABP5Q01469 135 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 ST3GAL3Q11203 375 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 LMAN2Q12907 356 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 RPA4Q13156 261 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 NFE2L1Q14494 772 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 GANABQ14697 944 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 TRAM2Q15035 370 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 GRK1Q15835 563 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 ETFDHQ16134 617 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 SNAPC1Q16533 368 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 DECR1Q16698 335 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMEM35AQ53FP2 167 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 CCDC157Q569K6 752 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 Q5BKY6 102 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF311Q5JNZ3 666 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 FAM69AQ5T7M9 428 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 GPR139Q6DWJ6 353 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 ADNP2Q6IQ32 1131 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 PYHIN1Q6K0P9 492 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 ANKRD54Q6NXT1 300 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 PODNL1Q6PEZ8 512 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 TEX261Q6UWH6 196 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF852Q6ZMS4 543 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 DEF8Q6ZN54 512 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 DPPA4Q7L190 304 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 DEFB132Q7Z7B7 95 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMPRSS11BQ86T26 416 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC9B2Q86UD5 537 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 TSPAN33Q86UF1 283 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 NUDT13Q86X67 352 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 MARCH9Q86YJ5 346 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 IQCF2Q8IXL9 164 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-55P-201ENST00000411092 MS4A15Q8N5U1 240 aa3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms