RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000406780.5

BBX-204, Transcript of BBX, HMG-box containing, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene BBX, Length 3,674 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBX-204ENST00000406780 ATG101Q9BSB4 218 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 FAM117AQ9C073 453 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 FN3KQ9H479 309 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 SMOC1Q9H4F8 434 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 TMEM38AQ9H6F2 299 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 PDFQ9HBH1 243 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 TRIM36Q9NQ86 728 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 EPHA6Q9UF33 1036 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 CAMK2AQ9UQM7 478 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 ZNF337Q9Y3M9 751 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 PTPRDP23468 1912 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 RLFQ13129 1914 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 A0A1W2PPH5 198 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 TMEM82A0PJX8 343 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 OR2AG2A6NM03 316 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 AQP8O94778 261 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 PCDH8O95206 1070 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 NFATC1O95644 943 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 ARG1P05089 322 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 UBBP0CG47 229 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 IRF1P10914 325 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 MGMTP16455 207 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 DLSTP36957 453 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 PSMB10P40306 273 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 ASMTP46597 345 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 PCP4P48539 62 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 GPR143P51810 404 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 TAS2R41P59536 307 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 AP3S2P59780 193 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 UBA52P62987 128 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 GUCA2AQ02747 115 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 PRKCZQ05513 592 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 CBFBQ13951 182 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 ZNF234Q14588 700 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 PON3Q15166 354 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 TEAD2Q15562 447 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 PCGF3Q3KNV8 242 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 RNF212Q495C1 297 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 ZNF311Q5JNZ3 666 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 PYY3Q5JQD4 70 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 TPRA1Q86W33 373 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 ARL14Q8N4G2 192 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 ARRDC1Q8N5I2 433 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 POGLUT1Q8NBL1 392 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 ZNF740Q8NDX6 193 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 DNAAF1Q8NEP3 725 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 OR4A4PQ8NGN8 299 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 UBTD2Q8WUN7 234 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 PMM1Q92871 262 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 FGF11Q92914 225 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 GAREM1Q9H706 876 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 OR2S2Q9NQN1 319 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 KLHL9Q9P2J3 617 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 PISDQ9UG56 409 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 GREB1Q4ZG55 1949 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 ARRDC5A6NEK1 342 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 F5H5T6 163 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 SOX15O60248 233 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
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BBX-204ENST00000406780 CPN1P15169 458 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 SPI1P17947 270 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 TACR2P21452 398 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 ACRV1P26436 265 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 GABRR2P28476 465 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 ID4P47928 161 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 MANFP55145 182 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 KCNAB1Q14722 419 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 SLC9A5Q14940 896 aa4.75□□□□□ -1.65
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BBX-204ENST00000406780 AADACL4Q5VUY2 407 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 FKBP1CQ5VVH2 108 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 CLEC9AQ6UXN8 241 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 TMEM200AQ86VY9 491 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 DMBX1Q8NFW5 382 aa4.75□□□□□ -1.65
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BBX-204ENST00000406780 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 RFKQ969G6 155 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 HIST1H2BAQ96A08 127 aa4.75□□□□□ -1.65
BBX-204ENST00000406780 ZG16BQ96DA0 208 aa4.75□□□□□ -1.65
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