RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 DGCR6LQ9BY27 220 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 UCK2Q9BZX2 261 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 HHATLQ9HCP6 504 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 ENOPH1Q9UHY7 261 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 PINLYPA6NC86 204 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 SP1P08047 785 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 SMIM18P0DKX4 95 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 GP1BBP13224 206 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 ELK4P28324 431 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 UCNP55089 124 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 CD47Q08722 323 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 NPAS1Q99742 590 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 APOL4Q9BPW4 351 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADAM19Q9H013 955 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 TACR3P29371 465 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 IL5RAQ01344 420 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC25A25Q6KCM7 469 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 BORAQ6PGQ7 559 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF730Q6ZMV8 503 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZER1Q7Z7L7 766 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 SULF2Q8IWU5 870 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC39A7Q92504 469 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 HRASLS5Q96KN8 279 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 PTGES2Q9H7Z7 377 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 MED17Q9NVC6 651 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A087WV48 116 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 TNFSF10P50591 281 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 KCTD21Q4G0X4 260 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 LINC00114Q6XXX2 140 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR2M7Q8NG81 312 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 CD46P15529 392 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRKCAP17252 672 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 C1orf94Q6P1W5 598 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 POMZP3Q6PJE2 187 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM239Q8WW34 195 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM234Q8WY98 164 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 MPP4Q96JB8 637 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 C5orf34Q96MH7 638 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM173AQ9BQD7 235 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 REV1Q9UBZ9 1251 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A087WUJ7 227 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRRC3CA6NJW4 275 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 NME2P1O60361 137 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 NME2P22392 152 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 CD97P48960 835 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 ESRRGP62508 458 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 CXADRP78310 365 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 RRM2BQ7LG56 351 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 P3H2Q8IVL5 708 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 TSPAN14Q8NG11 270 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 ST8SIA1Q92185 356 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 OSGIN1Q9UJX0 560 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGF2RP11717 2491 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 SHISA8B8ZZ34 492 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 PIP5K1CO60331 668 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 OSMP13725 252 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 GGT2P36268 569 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 IFNGR2P38484 337 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 FOXO1Q12778 655 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLPPR5Q32ZL2 321 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 ELOA3BQ3SY89 546 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF766Q5HY98 468 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 GRINAQ7Z429 371 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 NRMQ8IXM6 262 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 ELOA3Q8NG57 546 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 FBLIM1Q8WUP2 373 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF426Q9BUY5 554 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 CBR3O75828 277 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 PNMTP11086 282 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 CHMP24386 653 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 GSSP48637 474 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 CRISP1P54107 249 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 TBR1Q16650 682 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 PFN4Q8NHR9 129 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 SCMH1Q96GD3 660 aa25.13■■□□□ 1.61
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