RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361320.4

LRRTM3-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM3, Length 4,358 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3-201ENST00000361320 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 MAGIXQ9H6Y5 334 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 FBXO8Q9NRD0 319 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 MYOTQ9UBF9 498 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC6A5Q9Y345 797 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 PCNX2A6NKB5 2137 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 PCDH17O14917 1159 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF208O43345 1280 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 LILRB5O75023 590 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 BMP4P12644 408 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 NID1P14543 1247 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 PNLIPRP2P54317 469 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 DUSP2Q05923 314 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 DCAF10Q5QP82 559 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 SPINK14Q6IE38 97 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 C3orf33Q6P1S2 294 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 C11orf88Q6PI97 169 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 CBLL1Q75N03 491 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC16A14Q7RTX9 510 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF687Q8N1G0 1237 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 LRRC18Q8N456 261 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM181AQ8N9Y4 354 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 OR13C2Q8NGS9 318 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 OR8S1Q8NH09 359 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC41A2Q96JW4 573 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 OR52D1Q9H346 318 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 CHRNA9Q9UGM1 479 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF225Q9UK10 706 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 AKAP6Q13023 2319 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 A8MVM7 634 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 DLGAP3O95886 979 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 IGLV3-19P01714 112 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 CELP19835 753 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ABCD3P28288 659 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 RIDAP52758 137 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 PSPHP78330 225 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 APOFQ13790 326 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 C6orf89Q6UWU4 347 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 PSD4Q8NDX1 1056 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 PRR7Q8TB68 274 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 MED18Q9BUE0 208 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 TMED9Q9BVK6 235 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 SP140LQ9H930 580 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ABCB9Q9NP78 766 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF337Q9Y3M9 751 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 A0A087WV62 115 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 A0A1W2PPV9 198 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 H7C1C5 153 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 CBR3O75828 277 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 APOC1P02654 83 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 LYNP07948 512 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 MSL3P1P0C860 447 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF883P0CG24 379 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 IRF2P14316 349 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 GPX2P18283 190 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ARRB2P32121 409 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 RPL5P46777 297 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 POU3F4P49335 361 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 STARP49675 285 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 CLDN15P56746 228 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 LCN6P62502 163 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 PDE7AQ13946 482 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 C1orf140Q5VVS0 124 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 SHFQ7M4L6 423 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 PACRGLQ8N7B6 248 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ZBTB44Q8NCP5 570 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 TTC9Q92623 222 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF566Q969W8 418 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 APH1AQ96BI3 265 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM173AQ9BQD7 235 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 KATNB1Q9BVA0 655 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ASIC5Q9NY37 505 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 KLHL9Q9P2J3 617 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ABCA4P78363 2273 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 C19orf67A6NJJ6 358 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM183AA6NL82 134 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 HMGN4O00479 90 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 XPNPEP2O43895 674 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 BIDP55957 195 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ARFRP1Q13795 201 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 DUSP7Q16829 419 aa6.49□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 MICAQ29983 383 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms