RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331163.10

PDGFB-201, Transcript of platelet derived growth factor subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFB, Length 3,497 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PDGFB-201ENST00000331163 CD226Q15762 336 aa14.57□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 CT45A2Q5DJT8 189 aa14.57□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 PAMR1Q6UXH9 720 aa14.57□□□□□ -0.08
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