RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 AASSQ9UDR5 926 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
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RABGGTB-201ENST00000319942 CDH10Q9Y6N8 788 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 VCANP13611 3396 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 M0R3G1 203 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 ADAM11O75078 769 aa9.23□□□□□ -0.93
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RABGGTB-201ENST00000319942 FSTP19883 344 aa9.23□□□□□ -0.93
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RABGGTB-201ENST00000319942 NBL1P41271 181 aa9.23□□□□□ -0.93
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RABGGTB-201ENST00000319942 OAFQ86UD1 273 aa9.23□□□□□ -0.93
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RABGGTB-201ENST00000319942 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 STX19Q8N4C7 294 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 OR11G2Q8NGC1 345 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 PFN4Q8NHR9 129 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa9.23□□□□□ -0.93
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RABGGTB-201ENST00000319942 APH1BQ8WW43 257 aa9.23□□□□□ -0.93
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RABGGTB-201ENST00000319942 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
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RABGGTB-201ENST00000319942 EGLN3Q9H6Z9 239 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 MED17Q9NVC6 651 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
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RABGGTB-201ENST00000319942 OR52D1Q9H346 318 aa9.22□□□□□ -0.93
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RABGGTB-201ENST00000319942 AMBNQ9NP70 447 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 C20orf141Q9NUB4 165 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 ERVK-18Q9QC07 812 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 BAIAP2Q9UQB8 552 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGGTB-201ENST00000319942 IRGMA1A4Y4 181 aa9.21□□□□□ -0.93
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